数据集概述
该数据集围绕多洛过程（Dollo process）下的二元（存在/缺失）数据距离展开研究，引入了新型的加性多洛距离（ADD），通过模拟数据对比多种二元距离的性能，并将ADD应用于桉树DArT数据集和细菌基因家族数据，提供相关案例分析结果。
文件详解
- 案例研究文件（.nex格式）：
- Adnataria_casestudy.nex：桉树Adnataria系列案例研究数据文件
- Eucalyptus_casestudy.nex：桉树物种案例研究数据文件
- Cogs_casestudy.nex：细菌COG数据库基因家族案例研究数据文件
- padd_Dollo_template.nex：多洛数据模板文件
- 程序文件：
- add_Dollo_dist.pl：ADD距离计算的Perl脚本
- 文档文件（.pdf格式）：
- Provenance information for Adnataria.pdf：Adnataria案例研究来源信息文档
- OnlineSupplementaryMaterial.pdf：在线补充材料文档
适用场景
- 系统发育学研究：用于多洛过程下二元性状数据的距离计算与系统发育树构建
- 基因组数据分析：应用于基因家族存在/缺失数据的系统发育分析
- 植物分类学研究：支持桉树等物种的系统发育关系解析
- 生物信息学方法评估：对比不同二元距离在多洛数据中的性能表现
