Enterobacter_roggenkampii_B1_01基因组特征数据集

数据集概述

本数据集为MRA文章《Enterobacter roggenkampii菌株B1-01的基因组草图序列》的支撑信息,B1-01是从竹根分离的潜在促生细菌,包含其基因组特征相关的7个文件,支持细菌功能与分类研究。

文件详解

  • 文件名称:Isolation medium for Enterobacter B1-01.txt,格式:.txt,内容:记录Enterobacter roggenkampii B1-01的分离培养基配方,包括NF改良基础培养基的成分及每升蒸馏水的添加克数
  • 文件名称:Busco on Enterobacter B1-01_short summary.txt,格式:.txt,内容:Enterobacter B1-01的BUSCO分析简短总结
  • 文件名称:Busco on Enterobacter B1-01_full table.tabular,格式:.tabular,内容:Enterobacter B1-01的BUSCO分析完整结果表格
  • 文件名称:B1-01_RAST_Subsystem Features.tsv,格式:.tsv,内容:包含菌株B1-01的RAST子系统特征数据,字段有Category(类别)、Subcategory(子类别)、Subsystem(子系统)、Role(功能角色)、Features(特征)等,示例为铁获取与代谢相关的肠杆菌素生物合成基因
  • 文件名称:B1_01_UnicyclerAssembly.fasta,格式:.fasta,内容:Enterobacter roggenkampii B1-01的Unicycler基因组组装序列
  • 文件名称:CheckM_Enterobacter B1-01_summary_table.tsv,格式:.tsv,内容:菌株B1-01的CheckM分析汇总表,字段包括Bin Name(组装名称)、Marker Lineage(标记谱系)、Completeness(完整性)、Contamination(污染率)等,示例完整性为99.96%、污染率为0
  • 文件名称:B1_01_AntiSMASH_v8.zip,格式:.zip,内容:Enterobacter roggenkampii B1-01的AntiSMASH v8分析结果压缩包

适用场景

  • 微生物基因组学研究:分析Enterobacter roggenkampii B1-01的基因组结构与功能特征
  • 细菌分类学验证:基于BUSCO、CheckM结果评估菌株的分类地位与基因组完整性
  • 植物促生机制探索:通过RAST子系统注释研究菌株的潜在促生相关基因(如铁获取代谢)
  • 天然产物挖掘:利用AntiSMASH结果预测菌株的次级代谢产物合成潜力
  • 微生物培养研究:参考分离培养基配方进行目标菌株的实验室培养与复现
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.76 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。