数据集概述
本数据集围绕昆虫环境元条形码的分类偏倚展开研究，通过计算机模拟PCR比较新设计16S标记与现有16S、COI标记的分类覆盖度和分辨率，并结合体外实验验证。数据包含模拟与实验相关的测序 reads 及参考序列，用于分析元条形码标记的分类偏倚问题，共2个文件。
文件详解
- Enviro metabarcodes for insects PGM demultiplexed reads.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含高通量扩增子测序产生的超过600万条reads数据，来源于14个物种（11个昆虫目和1个蛛形纲）的人工DNA混合物经5组引物（靶向COI或16S）PCR扩增后的结果。
- Reference_sequences.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于计算机模拟PCR的参考序列数据，涉及具有完整线粒体基因组的昆虫物种序列，支持新设计与现有元条形码标记的分类覆盖度和分辨率比较。
数据来源
论文“Environmental metabarcodes for insects: in silico PCR reveals potential for taxonomic bias”
适用场景
- 昆虫元条形码标记评估: 分析不同16S、COI标记的分类覆盖度和分辨率，筛选低偏倚的元条形码标记。
- 分类PCR偏倚研究: 验证计算机模拟PCR对混合模板PCR分类偏倚的预测能力，探究COI标记对鳞翅目、双翅目等类群的偏好性。
- 生物多样性检测: 评估新设计16S标记在体外实验中对多类群昆虫的检测效率，支持昆虫群落多样性的准确估计。
- 测序数据应用: 利用超过600万条reads数据，开展高通量测序技术在昆虫分类中的应用研究。
