数据集概述
本数据集包含澳大利亚Eugongylus组石龙子(Squamata: Scincidae)的系统发育分析数据,涉及锚定杂交富集(AHE)和转录组挖掘两种方法获取的基因位点序列,用于评估不同分类尺度下(属间、种间、种内系统地理)的系统发育信息含量,支持石龙子类群的亲缘关系研究及谱系分化参数推断。
文件详解
- README说明文档
- 文件名称:README_for_Eugongylus_Dryad_data.txt
- 文件格式:TXT
- 内容介绍:包含数据关联的研究论文信息、数据用途说明、文件清单及数据使用说明,提供作者联系方式以解答数据使用疑问。
- 数据压缩包
- 文件名称:Eugongylus_Dryad_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包内包含支持澳大利亚Eugongylus组石龙子系统发育分析的原始数据及相关脚本文件,具体内容需解压后查看。
数据来源
Dryad数据平台(关联研究:Brandley et al. 2015. Evaluating the phylogenetic informativeness of anchored enrichment loci at the tips of the tree of life: an analysis using Australian Eugongylus group scincid lizards)
适用场景
- 爬行动物系统发育研究:用于构建澳大利亚Eugongylus组石龙子的系统发育树,分析属间、种间及种内谱系的亲缘关系。
- 锚定杂交富集技术评估:验证AHE方法在不同分类尺度(尤其是种内系统地理尺度)的系统发育信息有效性。
- 谱系分化参数推断:利用AHE位点数据,通过隔离迁移的溯祖模型估算近缘谱系的分化时间及基因流参数。
- 生物信息学方法验证:对比锚定杂交富集与转录组挖掘两种方法获取的基因位点在系统发育分析中的表现差异。