数据集概述
本数据集基于外显子捕获古基因组学技术，解析九带犰狳物种复合体，识别出圭亚那地盾特有新物种。包含主文图表、补充图表、线粒体基因组、核基因数据集、物种界定、群体遗传分析等12类压缩文件，覆盖从数据处理到结果可视化的全流程信息，支撑物种分类与基因组研究。
文件详解
- 01_Figures_&_tables_of_the_main_text.zip：主文图表压缩包，含系统发育关系、个体谱系分配、遗传方差主成分分析、物种分布与遗传组成图等
- 02_Supplementary_tables_&_figures.zip：补充图表压缩包，含核基因位点分布、线粒体覆盖度、污染检测、遗传多样性、系统发育树、基因流分析、群体结构等内容
- 03_Mitogenomes.zip：线粒体基因组压缩包，含参考序列、串联线粒体基因序列、系统发育树、覆盖度统计等
- 04_Reanalyses.zip：再分析数据压缩包，含D-loop和16S rRNA序列比对及系统发育树
- 05_Contamination_exploration.zip：污染探索压缩包，含线粒体诊断位点表、个体读段支持率表、R分析脚本
- 06_Nuclear_dataset.zip：核基因数据集压缩包，含外显子参考序列、捕获探针序列、二倍体核基因序列、覆盖度统计、基因位点位置信息等
- 07_Disentangling_genotyping_errors.zip：基因分型误差解析压缩包，含杂合度与近交系数表、R绘图脚本
- 08_Distribution_maps.zip：分布地图压缩包，含个体坐标表、R绘图脚本、线粒体与核基因谱系分布地图
- 09_Phylogenetic_inference.zip：系统发育推断压缩包，含串联核基因序列、系统发育树、溯祖树、基因流分析结果等
- 10_Species_delimitation.zip：物种界定压缩包，含BPP、bPTP、GMYC、PHRAPL等方法的输入输出数据与脚本
- 11_Population_genetic_analyses.zip：群体遗传分析压缩包，含PCA、ADMIXTURE、遗传统计量计算等数据与脚本
- 12_Morpho_molecular_distribution.zip：形态分子分布压缩包，含个体坐标表、R绘图脚本、头骨形态图片等
适用场景
- 物种分类学研究：解析九带犰狳物种复合体分类地位，验证圭亚那地盾新物种有效性
- 基因组学分析：研究外显子捕获数据的处理流程、基因位点特征与遗传多样性
- 群体遗传学研究：分析犰狳群体的遗传结构、基因流与系统发育关系
- 古基因组学方法验证：探索博物馆标本与新鲜组织样本的污染检测及数据处理方法
- 生物地理学研究：结合分布地图分析犰狳物种的地理分布格局与演化历史
