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台湾苏铁复合体转录组分析与物种界定数据集
2025年12月12日 30 159 124
数据集概述 本数据集围绕苏铁属（Cycas）植物展开，聚焦台湾苏铁复合体的物种界定问题。通过对海南特有濒危物种海南苏铁和昌江苏铁进行转录组测序，开发单拷贝核基因标记，并结合多物种溯祖模型（BPP）评估物种界限，为该复合体的分类学处理提供基因组证据。 文件详解 文件名称:...
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幽灵基因渐渗检测研究数据集
2025年12月12日 30 50 39
数据集概述 本数据集围绕幽灵基因渐渗检测展开，通过数学分析、模拟及实证研究，对比HyDe、PhyloNet/MPL、BPP等方法的检测性能，发现全似然法BPP可利用拓扑结构与分支长度信息准确识别幽灵基因渐渗，并包含茄科Jaltomata属14种植物的实证分析数据。 文件详解 文件名称：README.md 文件格式：Markdown...
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海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系物种边界与微特有性假设检验数据集
2025年12月11日 30 71 54
数据集概述 本数据集围绕海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系的物种边界问题展开，通过基因组数据检验微特有性假设，探讨传统表型方法与高通量测序技术在物种界定中的应用差异，以及分子界定模型面临的进化因素与计算局限。 文件详解 分析结果文件（PDF格式）： supplementary_S5_topologies_IQtree_svdquartets.pdf：IQ-...
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贝叶斯物种界定对引导树推断误差鲁棒性研究数据集
2025年12月9日 30 190 109
数据集概述 本数据集围绕贝叶斯物种界定方法展开，通过模拟研究分析该方法在引导树由序列数据推断的真实场景下，对引导树推断误差的鲁棒性表现，为物种界定方法的可靠性研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：bppGuideTree.SupplFigs.pdf 文件格式：PDF (.pdf)...
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多物种溯祖模型在广布类群物种划分中的过度拆分研究数据集
2025年12月8日 0 204 114
数据集概述 本数据集为研究多物种溯祖（MSC）模型在广布类群物种划分中过度拆分问题的补充材料，基于美国奶蛇（Lampropeltis triangulum complex）遗传数据分析，包含支持研究结论的表格、附录文档及系统发育树、结构分析等图表文件，为理解MSC模型假设局限性及地理变异对物种界定的影响提供数据支撑。 文件详解 表格文件（PDF格式）：...
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物种界定方法准确性测试与蜥蜴实证研究数据集
2025年12月7日 30 166 91
数据集概述 本数据集围绕物种界定方法（SDMs）准确性展开，包含模拟数据与蜥蜴实证研究数据。核心内容为评估BPP、SpeDeSTEM和ABC三种方法在物种界定中的准确性，重点关注基因流对结果的影响，并将方法应用于Liolaemus darwinii复合体蜥蜴的物种界定研究。 文件详解 文档类文件: README_for_ABC_files.rtf:...
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分子物种界定方法比较数据集
2025年12月7日 30 199 117
数据集概述 本数据集围绕不同物种形成场景下分子物种界定方法的性能比较展开，通过模拟生成的合成数据及实际案例（熊和蜜蜂），分析GMYC、PTP、BPP三种方法的表现差异，探讨影响方法性能的关键因素。 文件详解 数据文件（.xlsx格式，共7个）： supplementary appendix 11.xlsx、supplementary appendix...
