海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系物种边界与微特有性假设检验数据集

数据集概述

本数据集围绕海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系的物种边界问题展开,通过基因组数据检验微特有性假设,探讨传统表型方法与高通量测序技术在物种界定中的应用差异,以及分子界定模型面临的进化因素与计算局限。

文件详解

  • 分析结果文件(PDF格式):
  • supplementary_S5_topologies_IQtree_svdquartets.pdf:IQ-TREE和SVDquartets方法生成的拓扑结构文件
  • supplementary_S4_snapp_species_v1.pdf:SNAPP物种界定分析结果文件
  • supplementary_S8_treemix.pdf:TreeMix分析结果文件
  • 分析脚本文件(TXT格式):
  • supplementary_S1_script1.txt:第一部分分析脚本
  • supplementary_S2_script2.txt:第二部分分析脚本
  • supplementary_S3_script3.txt:第三部分分析脚本(含GDI矩阵计算代码)
  • 压缩文件(ZIP格式):
  • supplementary_S7_tipdown_gdi.zip:Tipdown GDI分析相关文件压缩包
  • supplementary_S6_A10_species_delimitations_mcmc_files.zip:A10物种界定MCMC文件压缩包
  • 数据文件(XLSX格式):
  • dryad_file_T1_29march2021.xlsx:核心数据表文件
  • 文档文件(DOCX格式):
  • dryad_file_T2_29March2021.docx:补充说明文档

适用场景

  • 进化生物学研究:分析近缘物种的谱系分化与物种边界形成机制
  • 生物信息学应用:测试不同分子物种界定模型(如BPP、SNAPP+BFD*)的效能
  • 地衣生态学研究:探讨微特有性在地衣真菌中的分布模式
  • 基因组数据分析:研究杂交/基因渗入、不完全谱系分选对物种界定的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 319.18 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。