数据集概述
本数据集围绕海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系的物种边界问题展开,通过基因组数据检验微特有性假设,探讨传统表型方法与高通量测序技术在物种界定中的应用差异,以及分子界定模型面临的进化因素与计算局限。
文件详解
- 分析结果文件(PDF格式):
- supplementary_S5_topologies_IQtree_svdquartets.pdf:IQ-TREE和SVDquartets方法生成的拓扑结构文件
- supplementary_S4_snapp_species_v1.pdf:SNAPP物种界定分析结果文件
- supplementary_S8_treemix.pdf:TreeMix分析结果文件
- 分析脚本文件(TXT格式):
- supplementary_S1_script1.txt:第一部分分析脚本
- supplementary_S2_script2.txt:第二部分分析脚本
- supplementary_S3_script3.txt:第三部分分析脚本(含GDI矩阵计算代码)
- 压缩文件(ZIP格式):
- supplementary_S7_tipdown_gdi.zip:Tipdown GDI分析相关文件压缩包
- supplementary_S6_A10_species_delimitations_mcmc_files.zip:A10物种界定MCMC文件压缩包
- 数据文件(XLSX格式):
- dryad_file_T1_29march2021.xlsx:核心数据表文件
- 文档文件(DOCX格式):
- dryad_file_T2_29March2021.docx:补充说明文档
适用场景
- 进化生物学研究:分析近缘物种的谱系分化与物种边界形成机制
- 生物信息学应用:测试不同分子物种界定模型(如BPP、SNAPP+BFD*)的效能
- 地衣生态学研究:探讨微特有性在地衣真菌中的分布模式
- 基因组数据分析:研究杂交/基因渗入、不完全谱系分选对物种界定的影响