数据集概述
本数据集包含果蝇(Drosophila melanogaster)和红壁蜂(Osmia bicornis)的Trinity组装转录组数据,以及基因转录本延伸的相关文件。数据涉及转录组组装细节、部分基因转录本序列、延伸详情和软件评估结果,共6个文件,支持昆虫基因转录本延伸的研究分析。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:Drosophila_P450_partial_transcripts.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:果蝇P450基因的部分转录本序列文件
- 文件名称:Osmia_transcriptome.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:红壁蜂转录组序列文件
- 文件名称:Drosophila_transcriptome.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:果蝇转录组序列文件
- 文档文件
- 文件名称:Transcriptome_assembly_details.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:转录组组装的详细说明文档
- 文件名称:Other_software_evaluation_results.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:其他软件评估结果的说明文档
- 其他文件
- 文件名称:Osmia_P450s_CCEs_extension_details.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:红壁蜂P450和CCEs基因转录本延伸详情的表格文件
适用场景
- 昆虫转录组研究: 分析果蝇和红壁蜂的转录组序列,探索基因表达特征
- 基因转录本延伸分析: 基于RNA-Seq原始 reads 的迭代映射方法,研究部分基因转录本的延伸机制
- 基因家族分析: 针对P450和CCEs等基因家族,分析其转录本结构与功能
- 转录组组装软件评估: 对比不同软件的转录组组装效果,优化分析流程
- 昆虫分子生物学研究: 为果蝇和红壁蜂的基因功能研究提供转录组数据支持