番薯属两种牵牛花基因流与分化选择数据集

数据集概述

本数据集围绕番薯属两种姐妹牵牛花(Ipomoea cordatotriloba和I. lacunosa)的基因流、分化选择及渐渗抗性展开研究,通过基因组SNP数据揭示物种形成早期选择与基因流的复杂相互作用,为岛屿分化源于分化选择的理论提供实证支持。

文件详解

  • README_for_JG_LacRef_QD_DP_XTOME_SNPS.txt:文本文档,说明VCF文件中样本与表格S1的对应关系,包含样本编号、名称及后续修正的物种鉴定信息(如I. lacunosa)。
  • APL Pipeline III.PDF:PDF文档,可能记录数据分析所使用的APL流程或方法细节。
  • JG_LacRef_QD_DP_XTOME_SNPS.vcf:VCF格式文件,包含基于番薯属牵牛花参考基因组的SNP数据,用于分析基因流、渐渗抗性及选择模式。
  • lacunosa_genome_070416.fasta:FASTA格式文件,为I. lacunosa的基因组序列,作为SNP分析的参考基因组。

适用场景

  • 进化生物学研究:分析物种形成早期基因流与分化选择的相互作用机制。
  • 基因组学分析:探究岛屿分化模式的遗传基础及渐渗抗性的分子机制。
  • 群体遗传学研究:评估同域与异域种群间的遗传分化及基因交流程度。
  • 植物进化研究:以番薯属牵牛花为模型,揭示植物物种分化的基因组动态过程。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 593.81 MiB
最后更新 2025年12月26日
创建于 2025年12月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。