数据集概述
本数据集包含61,857株肺炎克雷伯菌基因组的流行病学分析结果，涵盖多位点序列分型、荚膜及寡糖类型、CRISPR-Cas系统、克隆群、耐药基因、毒力因子及质粒复制子等关键信息，为耐药传播研究提供支持。
文件详解
- 综合汇总文件：
- table_summary.txt、table_summary.xlsx、table_summary.pdf：包含基因组分型核心信息，字段示例：Assembly code（组装编号）、Clonal group（克隆群）、MLST ST（序列类型）、KL type（荚膜类型）、O type（寡糖类型）、CRISPR-Cas（CRISPR-Cas系统）
- 耐药基因数据文件：
- table_amr.txt、table_amr.xlsx：记录各菌株耐药基因携带情况
- 毒力因子数据文件：
- table_vfdb.txt、table_vfdb.xlsx：记录各菌株毒力因子携带情况
- 质粒复制子数据文件：
- table_plasmid.txt、table_plasmid.xlsx：记录各菌株质粒复制子携带情况
- cgMLST分型文件：
- table_cgmlst.txt：包含核心基因组多位点序列分型数据
数据来源
NCBI Genbank数据库
适用场景
- 肺炎克雷伯菌耐药机制与传播路径研究
- 高风险克隆群的流行病学监测
- 耐药基因、毒力因子及质粒的关联性分析
- 感染防控策略制定的基础数据支持
- 临床菌株基因组特征与表型关联研究
