数据集概述
本数据集包含研究“海拔非生物条件通过影响真菌可用性和关联强度塑造植物-真菌关联”的原始数据及分析脚本。数据基于Fennoscandia地区10个高低海拔Bistorta vivipara种群的真菌DNA样本,通过ITS2宏条形码技术鉴定出253个真菌OTU,覆盖641个采样单元(包括植物各部位及周边土壤、植物叶片)。数据集含9个文件,支持研究结果复现。
文件详解
- 分析脚本文件(.R格式,共6个)
- 文件名称:S1_define_all_models.R、S2_fit_models.R、S3_evaluate_convergence.R、S4_show_parameter_estimates.R、S5_Manuscript_Figures.R、as.phylo.formula.R
- 字段映射介绍:包含模型定义、拟合、收敛评估、参数估计及图表生成等分析流程代码
- 数据文件
- 文件名称:data_meta_otu.Rdata
- 文件格式:RData
- 字段映射介绍:存储Y、X、P三个核心数据对象,涵盖真菌OTU数据、元数据及关联参数
- 文档文件
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据内容及脚本运行方法
- 压缩文件
- 文件名称:Bioinformatics_bist_avail_sel_v1.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含生物信息学分析相关数据
适用场景
- 植物-真菌关联机制研究: 分析海拔非生物条件对Bistorta vivipara与真菌互作的影响
- 微生物生态学分析: 基于ITS2宏条形码数据研究真菌群落结构及分布规律
- 生态模型复现: 利用脚本文件复现海拔梯度下植物-微生物关联强度的统计分析结果
- 生物信息学方法应用: 参考真菌OTU鉴定及数据分析流程,优化相关研究技术路线