数据集概述
本数据集记录了马尾松（Pinus taeda）针叶内生真菌群落的物种组成、多样性及扩散模式，重点分析区域尺度和单株树木内的距离衰减关系，揭示稀有类群（平均占比<0.31%）对群落结构的驱动作用，以及城市区域对宿主-共生体生物地理格局的影响。数据集含42个文件，覆盖群落数据、距离矩阵、分类单元信息等。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Dataset_description.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集描述文档，提供研究背景、实验设计及数据说明
- 群落组成与多样性数据
- 文件名称：whole_BC.csv、rare_BC.csv、abund_BC.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：含不同类群（全部、稀有、丰富）的Bray-Curtis距离矩阵数据，记录样本间群落相似性
- 分类单元与距离矩阵数据
- 文件名称：LPSiteDistMat_All_noWithinStand.txt、LPSiteDistMat_NoCities.txt、LPDistanceMatrix_forTB_BT_BB.txt、Dothideo_MOTU.txt、bray_curtis_LP_MOTU_indiv_Doth_rare_CSS.txt、TTsamples.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：样本距离矩阵（含/不含城市区域、站点间距离）、Dothideomycetes类群分类单元信息、样本ID列表
- 生物信息数据
- 文件名称：rare_OTU.biom、rare_OTU_127.biom、abund_OTU.biom、DatasetS2.fasta
- 文件格式：BIOM、FASTA
- 字段映射介绍：稀有/丰富类群的OTU表（BIOM格式）、序列数据（FASTA格式）
- 分析代码
- 文件名称：OonoEtAl2017_DataOne.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：数据分析代码脚本
适用场景
- 微生物生物地理学研究：分析马尾松针内生真菌群落的距离衰减模式及驱动因子
- 稀有类群生态功能研究：探究稀有内生真菌类群对群落结构的影响机制
- 城市环境对植物微生物组的影响分析：验证宿主密度与多样性在共生体生物地理格局中的作用
- 真菌群落分类单元分析：基于Dothideomycetes类群数据研究特定真菌类群的分布规律
- 微生物群落相似性分析：利用Bray-Curtis距离矩阵开展群落结构比较与聚类研究
