数据集概述
本数据集包含土拉弗朗西斯菌的RNA寡核苷酸诱饵设计文件及17个样本的基因组组装数据。诱饵设计针对该菌染色体和质粒，排除人类同源序列；组装数据含17个样本的基因组序列及组装统计元数据，支持从临床样本直接进行全基因组捕获测序的验证与应用研究。
文件详解
- Francisella_tularensis_RNA_baits_INSA_PT.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含TargetID（目标ID）、ProbeID（探针ID）、Sequence（RNA诱饵序列）、Replication（重复数）等字段，记录54756条120bp RNA寡核苷酸诱饵的设计信息。
- Ft_assembly_metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：含17个土拉弗朗西斯菌样本的基因组组装统计数据，包括欧洲核苷酸档案库登录号等元数据。
- Ft_assemblies.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：压缩包内包含17个样本的基因组组装序列，文件格式为FASTA。
数据来源
未提供具体原始机构，关联信息为Agilent Technologies’ SureSelect target enrichment system、SureDesign软件及待发表的相关出版物。
适用场景
- 土拉弗朗西斯菌基因组研究：通过组装数据分析菌株遗传特征与变异。
- 临床样本测序方法验证：评估SureSelect靶向富集技术在临床样本直接测序中的应用效果。
- 微生物诊断工具开发：基于RNA诱饵设计优化临床样本中土拉弗朗西斯菌的检测方案。
- 基因组组装方法评估：利用元数据比较不同样本的组装质量与效率。
