Galápagos_Serpentes_Dipsadidae_蛇类辐射演化研究数据

数据集概述

本数据集围绕加拉帕戈斯蛇类辐射演化研究展开,包含系统发育分析相关的序列比对、字符集定义及时间校准树文件,支持揭示该类群的起源与隐藏多样性,涉及Pseudalsophis属等物种的分类与演化研究,共7个文件。

文件详解

  • 系统发育分析文件
  • 序列比对文件:RAxML_alignment_for_Figure-1.phy、RAxML_alignment_for_Figure-2.phy,格式为.phy,用于构建系统发育树的DNA序列比对数据
  • 字符集定义文件:RAxML_charset_for_Figure-1.txt,格式为.txt,包含DNA子集的位置划分信息,如Subset1、Subset2、Subset3对应的碱基区间
  • 系统发育树文件:RAxML_tree_for_Figure-1.tre、RAxML_tree_for_Figure-2.tre、BEAST_tree_for_Figure-3.tre,格式为.tre,分别为基于RAxML和BEAST方法构建的系统发育树结果
  • BEAST输入文件:BEAST_input_file_for_Figure-3.xml,格式为.xml,用于BEAST分析的参数设置与输入配置文件

数据来源

论文“Origin and hidden diversity within the poorly known Galápagos snake radiation (Serpentes: Dipsadidae)”

适用场景

  • 蛇类系统发育研究:利用序列比对与系统发育树文件,分析加拉帕戈斯蛇类的演化关系与分类地位
  • 生物多样性分析:基于演化数据揭示加拉帕戈斯蛇类的隐藏物种多样性
  • 物种起源与扩散研究:通过时间校准树探究Pseudalsophis属蛇类的殖民事件与演化时间线
  • 分子生态学研究:借助DNA字符集与序列数据,开展蛇类分子标记与遗传多样性分析
  • 系统发育方法验证:对比RAxML与BEAST两种方法构建的树结构,评估不同算法的适用性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.09 MiB
最后更新 2026年1月18日
创建于 2026年1月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。