数据集概述
本数据集包含高粱组蛋白修饰的自上而下质谱分析处理数据及脚本，研究两种基因型高粱在发育阶段和干旱胁迫下的组蛋白修饰变化，识别出二十六种组蛋白和六百七十七种组蛋白变体，为干旱适应表观遗传标记研究提供支持。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下：
- 根目录文件:
- 脚本文件: Script_step1.pl、Script_step2.pl、Script_step3.pl、Script_step5.pl、Script_step4.r等，为数据处理的代码文件
- 批处理文件: batch_step1.bat、batch_step2.bat、batch_step3.bat、batch_step5.bat等，用于批量执行数据处理步骤
- 补充文件: combine_fill.txt（文本格式，含组蛋白名称、质量、序列、修饰等字段）、sorghum_histone_Supporting_table.xlsx（Excel格式，可能为支持性表格）、UniProt_sorghum_focus.fasta、uniprot-Sorbi20171004_filter.fasta（FASTA格式，高粱蛋白序列文件）
- MSPF目录:
- 参数文件: 如Sorghum-Histone06221162L05.param（参数配置文件）
- 结果文件: 如Sorghum-Histone0622162L18_IcTarget.tsv（TSV格式，含扫描号、序列、修饰、蛋白质名称等字段）
- ProMex目录:
- 质谱数据文件: 如Sorghum-Histone06221162L05.ms1ft（ms1ft格式，质谱分析中间文件）
- Scan目录:
- 扫描统计文件: 如Sorghum-Histone06221162L05_ScanStats.txt（文本格式，扫描统计信息）
- TopPIC目录:
- 输出表文件: 如Sorghum-Histone06221162L05_ms2.OUTPUT_TABLE（文本格式，质谱分析结果表）
适用场景
- 植物表观遗传学研究: 分析高粱组蛋白修饰在干旱胁迫下的变化机制
- 作物抗逆机制研究: 挖掘高粱干旱适应相关的表观遗传标记
- 质谱数据分析方法研究: 参考自上而下质谱分析的组蛋白修饰数据处理流程
- 植物分子生物学研究: 探究组蛋白变体与植物发育及逆境响应的关联
