数据集概述
该数据集为HTML格式表格，记录了使用RADseq技术解析Geleznowia属（芸香科）物种边界时的SNP数据集筛选参数及结果，包含不同分析场景下的样本量、覆盖度、等位基因计数等关键指标，支持下游基因组分析。
文件详解
- 文件名称: table.html
- 文件格式: HTML（.html）
- 字段映射: 表格包含以下核心列
- Dataset: 数据集编号（1-4）
- Analysis: 对应的下游分析方法（PCA、STR等）
- Sampling: 样本类型（内群/系统发育分析样本）
- Number of samples: 样本数量
- Minimum sample cover (%): 最低样本覆盖度
- Minimum minor allele count: 最低次要等位基因计数
- SNPs per locus/SNPs: 每个位点SNP数或总SNP数
- Missing per sample (%): 样本缺失率（平均值及范围）
- Average depth per site: 每位点平均测序深度（平均值及范围）
适用场景
- 基因组学研究：用于RADseq技术在物种边界解析中的参数优化参考
- 系统发育分析：支持比较不同筛选策略对PCA、Structure、系统发育树构建等分析结果的影响
- 植物分类学研究：为芸香科Geleznowia属复杂类群的物种界定提供数据基础
- 生物信息学方法评估：分析不同SNP筛选参数对下游分析准确性的影响
