找到32个数据集

标签: 测序深度

过滤结果
  • 淋巴瘤_PDX模型_变异基因与CNV基因列表数据

    2026年2月1日 30 6 4

    数据集概述 本数据集包含淋巴瘤相关的过滤后变异位点及基因列表,涉及DLBCL、MCL、T-NHL、BL四种淋巴瘤类型,同时提供PDX模型样本与患者样本的共有点位、PDX模型衍生过程中获得/丢失的位点,以及预组装的CNV基因列表,可用于淋巴瘤基因变异与拷贝数变异研究。 文件详解 文件名称:Supplemental Table 4.xlsx...
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  • Dryad_成纤维细胞软基质克隆选择进化实验数据

    2026年2月1日 30 202 14

    数据集概述 本数据集记录小鼠成纤维细胞在软/硬基质中传代约90代的实验进化结果,包含祖先细胞及软基质选择系的生长速率、表型可塑性及转录组变化数据,验证反向可塑性驱动快速遗传进化的机制,支持细胞环境适应性进化研究。 文件详解 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • CHIVE_Sequencing_基因测序突变数据

    2026年1月31日 30 37 28

    数据集概述 本数据集为CHIVE测序相关的突变数据,包含一个Excel文件,记录了基因测序过程中检测到的突变信息,可用于生物信息学领域的基因变异分析与研究。 文件详解 文件名称:CHIVE_muts.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据

    2026年1月31日 30 19 2

    数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序(GBS)策略优化研究的数据,包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果,涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化,以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试,为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称:9pt-...
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  • VIH_VHA_Based_合并感染患者样本测序分析数据

    2026年1月30日 30 23 15

    数据集概述 本数据集为VIH(人类免疫缺陷病毒)与VHA(甲型肝炎病毒)合并感染患者样本的大规模测序分析结果数据,包含一份Excel格式文件,记录了相关测序分析的具体内容,可用于医学领域中合并感染的分子生物学研究。 文件详解 文件名称:Resultados secuenciación VHA-VIH.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Pinus_contorta_引入树种内生菌群落差异研究数据

    2026年1月29日 30 83 37

    数据集概述 本数据集为引入树种内生菌群落差异研究的原始数据摘要,基于全球网络站点(包括扭叶松引入区智利、新西兰、芬兰、苏格兰、瑞典及原产地加拿大、美国)的焦磷酸测序分析结果,对比扭叶松在原产地与引入地(与系统发育相似/相异树种共生环境)的根真菌内生菌群落组成差异,为理解土壤生物对引入树种生长及入侵的影响提供数据支持。 文件详解 文件名称:Raw...
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  • MCL_Based_患者诊断与复发阶段基因突变及CNV基因列表数据

    2026年1月27日 30 79 10

    数据集概述 本数据集包含25名套细胞淋巴瘤(MCL)患者诊断与复发阶段通过过滤的变异体完整列表、频繁及反复突变基因列表,以及拷贝数变异(CNV)基因列表。数据分为共享变异、新增变异、消失变异和特殊关注基因的变异与CNV变化四个子表,是研究MCL患者疾病进展分子机制的重要参考,仅含一个文件。 文件详解 文件名称:Supplemental table...
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  • Supplemental_Based_淋巴瘤细胞系缺氧适应多组学补充数据表

    2026年1月21日 30 192 47

    数据集概述 本数据集为淋巴瘤细胞系长期缺氧适应分子机制研究的补充数据表,包含代谢组、转录组差异表达、转录组基因集分析、蛋白质组差异表达及细胞系单核苷酸变异(SNV)特征五个表格文件,记录了Ramos和HBL2细胞系在常氧与缺氧适应状态下的多组学数据及变异信息。 文件详解 Supplemental Data Table - Metabolome.xlsx...
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  • Brachionus_基于轮虫入侵实验_性倾向迁移率遗传多样性交互作用数据

    2026年1月21日 30 186 150

    数据集概述 本数据集为轮虫(Brachionus plicatilis)入侵实验数据,探究性倾向、迁移率与本地遗传多样性对种群入侵成功率的交互影响。通过全基因组测序追踪移民特有等位基因,分析三者单独及联合作用,包含实验数据、处理代码及SNP数据,共4个文件,用于揭示扩散定居阶段的生态进化机制。 文件详解 数据文件 文件名称:propensity...
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  • AlBi_HHU_Based_遗传多倍体定相研究评估数据_Recomb2022

    2026年1月20日 30 126 26

    数据集概述 本数据集为Recomb 2022待提交论文“Genetic Polyploid Phasing using Marker Signals from Low-Depth Progeny Samples”的评估用数据,包含17个文件,用于遗传多倍体定相方法的验证与分析,数据由指定脚本生成或使用。 文件详解 定相数据文件(.gz格式)...
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  • Syncerus_caffer_Based_非洲水牛基因组SNP鉴定与表征数据集

    2026年1月19日 30 166 127

    数据集概述 本数据集是针对非模式生物非洲水牛(Syncerus caffer)的全基因组单核苷酸多态性(SNP)鉴定与表征研究数据,包含通过下一代测序技术开发的高置信度SNP标记信息,可用于分析种群遗传结构,助力理解非洲水牛种群动态。 文件详解 文件名称:SNP Syncerus caffer- Smitz.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • bioRxiv_Preprint_Hox蛋白选择性靶向染色质可及性研究补充表格数据

    2026年1月18日 30 207 27

    数据集概述 本数据集是bioRxiv预印本“Chromatin Accessibility Plays a Key Role in Selective Targeting of Hox Proteins”的补充表格,包含6个Excel文件,涵盖ChIP-...
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  • BMC_Genomics_Source_虎纹钝口螈SNP频率估算与转录本多态性研究数据

    2026年1月14日 30 192 29

    数据集概述 本数据集支持BMC Genomics发表的虎纹钝口螈SNP频率研究论文,包含454焦磷酸测序原始数据及组装contig序列,用于分析contig长度和测序深度对SNP频率估算的影响,以及编码与非编码转录本的SNP丰度差异,验证长非编码转录本保守性较低的假设。 文件详解 README文件...
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  • ZooKeys_Based_蛛形纲Travunioidea类群样本与UCE测序结果数据

    2026年1月14日 30 23 20

    数据集概述 本数据集是论文“A stable phylogenomic classification of Travunioidea”的补充材料1,包含分类单元样本及UCE测序结果数据表。数据聚焦蛛形纲盲蛛目Travunioidea类群,记录样本信息与测序结果,红色高亮样本为Starrett等2017年测序数据,共1个文件。 文件详解...
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  • Supplementary_material_4_from_昆虫样本测序深度补充数据_2024

    2026年1月11日 30 30 20

    数据集概述 本数据集是论文《Homogenization of insect bulk samples yields more comprehensive yet comparable biodiversity data than non-destructive...
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  • Zheng_et_al_Insects_Based_猛蚁肠道细菌组成与多样性研究补充文件_2021

    2026年1月7日 30 124 118

    数据集概述 本数据集为《Zheng et al-Insects-Bacterial Composition and Diversity of the Digestive Tract of Odontomachus monticola Forel and Ectomomyrmex javanus...
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  • Lefort_2017_Supplementary_material_3_卷心菜蚜虫食物网测序统计数据

    2026年1月3日 30 21 13

    数据集概述 本数据集为论文的补充材料3,包含针对卷心菜蚜虫食物网高吞吐量DNA测序的探索性统计数据,具体涉及不同国家的测序深度分析及MOTU(分子操作分类单元)稀疏性分析,用于解析高营养级相互作用。 文件详解 文件名称:oo_162814.docx 文件格式:DOCX...
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  • 黑猩猩亚种Pan_troglodytes的基因组纯化及正向选择推断数据_Archive_VCF_Dryad

    2025年12月30日 30 73 37

    数据集概述 本数据集基于外显子捕获技术,研究三种现存黑猩猩亚种(中部、东部、西部)的全基因组核苷酸多样性,包含SNVs和indels变异位点信息,以及选择压力相关分析结果,可用于探究黑猩猩亚种的遗传多样性、种群历史及选择作用差异。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_Archive_VCF_Dryad.rtf 文件格式:RTF...
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  • PhytoKeys补充材料第5卷_红叶杨梅_Myrsine_cirrhosa_植物标本的RADseq信息数据

    2025年12月29日 30 60 28

    数据集概述 本数据集为论文《Myrsine cirrhosa (Primulaceae), a distinctive new shrub species from Kaua'i, Hawaiian Islands》的补充材料5,包含用于RADseq分析的植物标本馆凭证信息、SRA登录号及测序统计数据,支持对该夏威夷新种植物的分类学研究。 文件详解...
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  • Mus_Transcription_Turnover_Genome_Evolution_Study_Data

    2025年12月29日 30 119 45

    数据集概述 本数据集聚焦鼠属(Mus)物种基因组转录组的进化周转研究,涵盖1000万年系统发育距离的类群采样。通过深度RNA测序分析,揭示转录状态在类群间的高周转率,以及非编码DNA在进化时间尺度下的转录潜能,为新基因起源机制研究提供基础数据。 文件详解 TaxonomicRestrictedExpressionWindows.zip 文件格式:ZIP...
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