数据集概述
本数据集为淋巴瘤细胞系长期缺氧适应分子机制研究的补充数据表，包含代谢组、转录组差异表达、转录组基因集分析、蛋白质组差异表达及细胞系单核苷酸变异（SNV）特征五个表格文件，记录了Ramos和HBL2细胞系在常氧与缺氧适应状态下的多组学数据及变异信息。
文件详解
- Supplemental Data Table - Metabolome.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Ramos和HBL2细胞系的代谢物测量列表，记录常氧与缺氧适应细胞的三次重复峰值面积值，提供除检测限以下代谢物外的平均log₂倍变化及校正P值。
- Supplemental Data Table - Transcriptome Differential Expression.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录缺氧适应HBL2和Ramos细胞系与常氧对照的转录本差异表达数据，包含倍变化、log₂倍变化、log₂CPM、F统计量、P值、错误发现率（FDR）及转录本显著上调/下调状态（ns为不显著）。
- Supplemental Data Table - Transcriptome Gene Set Analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含缺氧适应HBL2和Ramos细胞系与常氧对照的Reactome通路基因集富集分析结果。
- Supplemental Data Table - Proteome Differential Expression.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录缺氧适应HBL2和Ramos细胞系与常氧对照的蛋白质检测及差异表达数据。
- Supplemental Data Table - Cell lines SNV characterization.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含四种淋巴瘤细胞系及对应原发肿瘤（PT）样本的单核苷酸变异（SNV）和短插入缺失特征，记录等位基因频率（AF_CTRL、AF_PT、AF_PDCL）、测序深度（DP）、肿瘤样本变异对数优势比（TLOD）及Funcotator分析的Gencode和HGNC注释信息。
数据来源
论文“Long-term adaptation of lymphoma cell lines to hypoxia is mediated by diverse molecular mechanisms that are targetable with specific inhibitors”
适用场景
- 淋巴瘤细胞缺氧适应机制研究：分析代谢组、转录组、蛋白质组数据，揭示缺氧适应的分子调控网络。
- 抗肿瘤药物靶点筛选：基于差异表达的分子靶点，识别可被特异性抑制剂靶向的缺氧适应相关通路。
- 肿瘤细胞系变异特征分析：利用SNV数据研究淋巴瘤细胞系与原发肿瘤的遗传变异差异及进化关系。
- 多组学整合分析：整合代谢组、转录组、蛋白质组数据，构建淋巴瘤细胞缺氧适应的多维度分子模型。
