数据集概述
本数据集为轮虫(Brachionus plicatilis)入侵实验数据,探究性倾向、迁移率与本地遗传多样性对种群入侵成功率的交互影响。通过全基因组测序追踪移民特有等位基因,分析三者单独及联合作用,包含实验数据、处理代码及SNP数据,共4个文件,用于揭示扩散定居阶段的生态进化机制。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:propensity data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含轮虫性倾向相关实验数据
- 文件名称:Inv Exp.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含pob(种群)、volumen(体积)、clon(克隆)、mr(迁移率)、mr_l(迁移率水平)、prs_n(性倾向值)、psr(性倾向水平)、diversity(遗传多样性)、eggs(卵数)、Density(密度)、exito1(成功1)、fracaso1(失败1)等字段
- 文件名称:dataSNP.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含pob(种群)、volumen(体积)、clon(克隆)、mr(迁移率)、prs_n(性倾向值)、mr_l(迁移率水平)、psr(性倾向水平)、diversity(遗传多样性)、treatment(处理组)、frec_inv(入侵频率)、DP(测序深度)、exito(成功)、fracaso(失败)、SNP(单核苷酸多态性类型)等字段
- 代码文件
- 文件名称:Invasion experiment.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于分析轮虫入侵实验数据的R语言代码脚本
适用场景
- 种群入侵机制研究: 分析性倾向、迁移率及本地遗传多样性对轮虫入侵成功率的单独及交互影响
- 生态进化动力学分析: 探究扩散定居阶段生物性状与环境因素的协同作用
- 遗传多样性与入侵能力关联研究: 通过SNP数据揭示遗传多样性对种群入侵的调控机制
- 实验生态学数据分析: 为类似入侵实验的数据处理与统计分析提供代码参考
- 生态风险评估模型构建: 基于多因素交互作用结果,建立种群入侵风险预测模型