数据集概述
本数据集聚焦鼠属（Mus）物种基因组转录组的进化周转研究，涵盖1000万年系统发育距离的类群采样。通过深度RNA测序分析，揭示转录状态在类群间的高周转率，以及非编码DNA在进化时间尺度下的转录潜能，为新基因起源机制研究提供基础数据。
文件详解
- TaxonomicRestrictedExpressionWindows.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含分类群限制性表达窗口相关数据，可能涉及不同鼠属物种中特有的转录区域分析结果
- 200b_win.features.genomes.norm.ind.zip
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- 内容说明：200碱基窗口的基因组特征标准化数据，包含个体水平的转录组特征信息
- pop.200b.windows.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：种群水平的200碱基窗口转录组数据，可能涉及种群间转录组差异分析
- rarefaction.200b.windows.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：基于稀疏化分析的200碱基窗口转录组数据，用于评估测序深度对转录组覆盖度的影响
- resample.200b.windows.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：重采样后的200碱基窗口转录组数据，可能用于验证转录组分析结果的稳健性
数据来源
论文“Fast turnover of genome transcription across evolutionary time exposes entire non-coding DNA to de novo gene emergence”
适用场景
- 转录组进化动力学研究：分析鼠属物种间转录状态的周转率及进化规律
- 非编码DNA功能化研究：探究非编码区域在进化时间尺度下的转录潜能与新基因起源机制
- 基因组转录覆盖度分析：基于稀疏化数据评估不同测序深度对转录组检测的影响
- 种群转录组差异分析：利用种群水平数据研究鼠属不同种群间的转录组变异特征
- 转录组特征标准化研究：通过标准化基因组特征数据，探索转录组特征与基因组结构的关联
