GHOST模型系统发育分析数据集

数据集概述

本数据集围绕GHOST模型展开,包含系统发育分析相关的序列比对、树文件、补充文档及基因序列文件,用于验证该模型在处理异速进化序列时的性能,支持系统发育推断研究。

文件详解

  • 文件名称: Chiari_amnios248genes_nt.nex
  • 文件格式: .nex
  • 内容: 包含248个基因的核苷酸序列比对数据,用于系统发育分析。
  • 文件名称: t12SimsSpecific.tree1
  • 文件格式: .tree1
  • 内容: 模拟实验生成的系统发育树文件,用于验证GHOST模型的性能。
  • 文件名称: manuscript_GHOST_SB_4thRevision_Supplement.pdf
  • 文件格式: .pdf
  • 内容: 包含GHOST模型研究的补充材料,可能涉及实验方法、结果或附加分析。
  • 文件名称: electricFish.fa
  • 文件格式: .fa
  • 内容: 11种鱼类的钠通道基因序列文件,用于分析电鱼的进化信号。
  • 文件名称: t12SimsSpecific.tree2
  • 文件格式: .tree2
  • 内容: 另一组模拟实验生成的系统发育树文件,支持模型性能评估。

适用场景

  • 系统发育学研究: 验证GHOST模型在处理异速进化序列时的准确性和可靠性。
  • 进化生物学分析: 解析生物类群的系统发育关系,如龟类与主龙类的亲缘关系。
  • 基因序列分析: 研究特定基因(如钠通道基因)的进化信号和趋同进化现象。
  • 模型比较研究: 对比GHOST模型与传统模型在系统发育推断中的差异和优势。
  • 生物信息学应用: 开发和优化系统发育分析工具,提升进化数据的解读能力。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.1 MiB
最后更新 2025年12月19日
创建于 2025年12月19日
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