数据集概述
本数据集围绕北美西部科罗拉多河流域两种特有同域鱼类（Gila cypha和G. robusta）的杂交基因侵蚀展开研究，包含368个个体的ddRAD测序相关数据，用于分析人为栖息地改变对物种繁殖隔离、基因渐渗及生物多样性的影响。
文件详解
- 样本元数据文件
- 文件名称：gila_ub_sra_metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含研究样本的SRA元数据信息，支持样本溯源与实验设计关联
- 补充材料文档
- 文件名称：GilaUB_SuppMat_submit_29May19.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究相关的补充材料文档，可能包含实验方法、结果补充说明等内容
- 基因型数据压缩包
- 文件名称：gila_ub_snps.tar.gz、gila_ub.vcf.tar.gz、gila_ub_introgress.tar.gz、gila_ub.str.tar.gz、gila_newhyb.tar.gz、gila_ub.loci.tar.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：包含SNPs、VCF格式基因型、基因渐渗分析、种群结构、杂交分析、基因座等相关数据的压缩包，支持基因侵蚀与杂交模式的深入分析
数据来源
论文“Hybridization drives genetic erosion in sympatric desert fishes of western North America”
适用场景
- 鱼类种群遗传学研究: 分析Gila属鱼类的基因结构、遗传多样性及种群分化特征
- 杂交基因侵蚀机制分析: 探究人为干扰下物种间杂交对基因纯合度的影响及基因渐渗模式
- 生物多样性保护评估: 基于基因数据评估栖息地改变对特有鱼类生物多样性的威胁程度
- 同域物种繁殖隔离研究: 验证同域分布鱼类的繁殖隔离完整性及人为因素对隔离的破坏作用
- 生态适应性进化分析: 分析杂交后代与亲本的适应性差异，探究环境变化下的物种进化响应
