数据集概述
本数据集来自国际水稻研究所（IRRI）的水稻基因组选择与关联映射研究，针对363个精英育种系，通过73147个标记进行基因分型，结合全基因组关联研究（GWAS）和五倍交叉验证，分析基因组选择（GS）在水稻育种中的有效性，探索性状遗传结构、训练群体组成等因素对预测准确性的影响。
文件详解
- MET_crfilt_.90_outliers_removed_for_RRBlup_line_corrected.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含水稻育种系的标记数据及表型相关信息，用于RR-BLUP模型分析，已去除异常值
- binned_subsets_2_14.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含按区间划分的标记子集数据
- MET_crfilt_.75_allchrom.hmp.txt.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含过滤后的全染色体HapMap格式标记数据
- random_subsets_from_.75_crFilt.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含从过滤数据中随机抽取的标记子集数据
- RYT_plotdata_by_GHID_corrected_PUBLIC_ACCESS.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含按GHID分类的水稻产量相关绘图数据，已校正并开放访问
数据来源
International Rice Research Institute (IRRI)
适用场景
- 水稻基因组选择育种效率评估: 分析不同统计模型、标记数量对水稻性状预测准确性的影响
- 作物遗传结构研究: 通过GWAS探索水稻产量、株高、开花时间等性状的遗传基础
- 育种标记优化: 确定水稻基因组选择所需的最小标记密度（如每0.2 cM一个标记）
- 统计模型在作物育种中的应用: 比较RR-BLUP、随机森林等模型在不同性状预测中的表现
- 热带水稻育种策略优化: 为IRRI等机构的热带水稻育种提供基因组选择技术支撑
