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标签: GWAS

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  • GWAS结核菌素皮肤试验反应性基因关联数据

    2026年2月1日 30 52 46

    数据集概述 本数据集为东非结核病高流行区HIV阳性个体结核菌素皮肤试验(TST)反应性的全基因组关联研究(GWAS)数据,包含坦桑尼亚和乌干达队列的基因分型数据、统计模型结果及文件说明文档,用于分析与MTB感染抵抗相关的遗传位点,特别是5q31.1区域与IL9基因的关联。 文件详解 基因分型数据文件 文件名称:tanzanian map...
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  • 大麦HsDry2_2基因座产量性状关联分析数据

    2026年2月1日 30 188 64

    数据集概述 本数据集包含大麦HEB-25多亲本作图群体在两年、两种水分环境(充分灌溉WW和水分限制WL)下的基因型和田间表型数据,涉及开花时间(HEA)、单株产量(PGY)等10个性状,用于全基因组关联分析(GWAS)挖掘与环境互作的数量性状位点(QTL),重点研究2号染色体HsDry2.2基因座对产量性状的调控作用。 文件详解 文件名称:LOM et...
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  • ETV6_Based结直肠癌易感性基因变异研究数据

    2026年1月31日 30 135 116

    数据集概述 本数据集为结直肠癌易感性相关的GWAS研究数据,包含中国及欧洲人群的病例对照样本分析结果,聚焦12p13.2区域ETV6基因rs2238126变异与结直肠癌风险的关联,涉及发病年龄、转录增强子结合亲和力及肿瘤组织ETV6表达水平等研究内容。 文件详解 文件名称:Colorectal_cancer_data.zip 文件格式:ZIP...
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  • GS_Based_水稻基因组选择与关联映射研究数据

    2026年1月31日 30 210 147

    数据集概述 本数据集来自国际水稻研究所(IRRI)的水稻基因组选择与关联映射研究,针对363个精英育种系,通过73147个标记进行基因分型,结合全基因组关联研究(GWAS)和五倍交叉验证,分析基因组选择(GS)在水稻育种中的有效性,探索性状遗传结构、训练群体组成等因素对预测准确性的影响。 文件详解...
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  • GS_de_novo_GWAS_热带水稻基因组预测模型数据

    2026年1月30日 30 49 8

    数据集概述 本数据集包含热带水稻多环境试验表型数据及说明文档,用于支持结合de novo GWAS的基因组选择(GS)模型研究。该模型旨在提升水稻育种效率,应对气候变化等粮食安全挑战。数据集含2个文件,涵盖表型数据及文件说明。 文件详解 README_for_MET_2011_2012_pheno_data_all.rtf 文件格式:RTF...
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  • pLARmEB_Based_多基因座全基因组关联研究方法数据

    2026年1月29日 30 77 5

    数据集概述 本数据集支持pLARmEB方法(基于多基因背景控制的最小角回归结合经验贝叶斯)的应用,该方法用于多基因座全基因组关联研究(GWAS),可识别与复杂性状相关的数量性状核苷酸(QTNs),通过模型变换白化多基因矩阵协方差与环境噪声,平衡QTN检测能力、效应估计准确性与计算效率。 文件详解 文件名称:data.zip 文件格式:ZIP...
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  • 整合基因组学_哺乳动物肺泡巨噬细胞对细胞内分枝杆菌的反应数据集

    2026年1月29日 30 8 2

    数据集概述 本数据集基于牛肺泡巨噬细胞感染牛分枝杆菌(M. bovis)的转录组研究,包含24小时和48小时感染组与对照组的RNA-seq统计结果。通过差异表达、相关网络及差异表达网络三种方法生成6个基因集,并结合牛结核(bTB)品种GWAS数据,使用gwinteR工具整合分析,识别与感染易感性/抗性相关的优先级SNP,揭示不同牛品种的遗传差异。...
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  • Setaria_pan_genome_谷子泛基因组研究表型数据

    2026年1月28日 30 100 32

    数据集概述 本数据集包含用于谷子全基因组关联分析(GWAS)和基因组选择(GS)研究的226个表型数据,可用于基因鉴定、标记辅助育种、基因组选择及基因组编辑,以加速不同气候条件下的作物改良。数据集仅含一个文件。 文件详解 表型数据文件 文件名称:Phenotypes_226.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 利用全基因组关联分析_GWAS_增强玉米群体基因组预测的补充数据

    2026年1月28日 30 187 28

    数据集概述 本数据集为玉米多亲本群体中整合全基因组关联研究(GWAS)与基因组预测(GP)方法的研究补充数据,包含玉米嵌套关联作图群体的表型数据与标记数据,用于验证GWAS结果整合对GP准确性的提升效果,支持基因发现与基因组预测模型优化研究。 文件详解 README文件...
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  • Teno_Based_大西洋鲑鱼自然种群海龄变异遗传机制研究数据

    2026年1月28日 30 142 47

    数据集概述 本数据集包含北欧大西洋鲑鱼自然种群海龄变异的基因组SNP分析数据,通过GWAS和FST离群分析识别与海龄相关的基因组区域,涉及肌肉发育、代谢、免疫反应和配偶选择等相关基因,揭示海龄变异的遗传基础及种群分化机制。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_TenoSeaAgeDryadData.txt 文件格式:TXT...
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  • HDHB_SNPAssay_蜜蜂100K单核苷酸多态性阵列开发数据

    2026年1月27日 0 128 17

    数据集概述 本数据集围绕新开发的蜜蜂高密度SNP基因分型阵列(含103270个SNP)展开,该阵列用于蜜蜂基因组选择、育种及进化适应研究。SNP通过对欧洲61只雄蜂全基因组重测序检测,筛选基于候选区域、基因及育种目标(产蜜量、温顺性、瓦螨抗性)等标准,包含阵列验证及使用建议相关数据,共4个文件。 文件详解...
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  • UK_Biobank_Based_背痛相关表型基因关联分析结果数据

    2026年1月27日 30 25 7

    数据集概述 本数据集为背痛相关表型的基因关联分析结果,基于英国生物银行(UK Biobank)的500K全基因组关联研究(GWAS)插补基因型数据和200K外显子测序(WES)数据生成,包含慢性背痛(CBP)、椎间盘疾病(IDD)、背痛(Dorsalgia)及综合表型(SGIT)四类表型的关联分析结果,共8个文件。 文件详解...
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  • WtCoxG_Based_加权Cox回归GWAS时间事件表型研究数据

    2026年1月26日 30 99 98

    数据集概述 本数据集为基于加权Cox回归(WtCoxG)方法的全基因组关联研究(GWAS)数据,针对时间事件表型设计。包含7个文件,涉及模拟研究与英国生物银行(UK Biobank)真实数据分析结果,覆盖2型糖尿病、冠状动脉粥样硬化等表型,用于验证WtCoxG方法的统计功效与准确性。 文件详解 CSV格式文件(共4个)...
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  • WM_800_MAGIC_Based冬小麦群体单倍型块与单倍型分析数据

    2026年1月26日 30 121 4

    数据集概述 本数据集包含冬小麦MAGIC群体WM-800的单倍型块(HBs)和单倍型(HTs)数据,基于小麦15k Infinium和135k Affymetrix...
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  • Drosophila_Based_果蝇卵滞留与受精成功遗传学研究数据

    2026年1月23日 30 127 110

    数据集概述 本数据集包含91个果蝇遗传参考面板(DGRP)品系的卵滞留与受精成功相关数据,通过显微观测方法获取表型变异,并结合全基因组关联分析探究遗传基础。数据涵盖品系均值、计数方法说明及原始计数结果,可用于研究果蝇繁殖性状的遗传机制及卵胎生进化路径。 文件详解 文档文件(Document files)...
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  • HLA_Based_人类白细胞抗原区域单倍型多效性疾病关联研究补充数据

    2026年1月22日 30 105 1

    数据集概述 本数据集为HLA区域单倍型分析相关研究的补充表格,包含FinnGen数据库中2459种疾病的关联分析信息,涉及疾病分类、GWAS富集分析、SNP与单倍型关联结果、UK Biobank验证数据等核心内容,支持HLA区域多效性疾病关联的深入研究。 文件详解 补充表格文件(共8个核心表格) 文件名称:Supplementary Table...
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  • GWAS_Post_GWAS_猪繁殖性状基因功能分析与候选基因注释数据

    2026年1月22日 30 188 45

    数据集概述 本数据集为猪繁殖性状基因功能分析研究的附录与附件,包含从GWAS到后GWAS过程中筛选的候选基因、变异注释及基因网络构建相关数据。研究通过系统综述筛选十四篇文献,获得2077个候选基因,结合结构变异后保留306个基因,优先标注了与窝仔数、乳头数相关的关键基因及其生物学过程,可支持猪繁殖性状的遗传机制研究与育种应用。 文件详解...
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  • Wheat_GWAS_Based小麦产量及组分性状全基因组关联研究数据集

    2026年1月21日 30 118 114

    数据集概述 本数据集来自小麦全基因组关联研究(GWAS),包含280份普通小麦基因型的表型与基因型数据。表型数据涵盖抽穗期、灌浆持续期、单穗粒数等6个产量及组分性状,在5个环境下测定;基因型数据基于Axiom小麦育种芯片的14,790个高质量SNP标记。数据用于定位调控小麦产量相关性状的基因组区域。 文件详解...
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  • Petal_size_Based_油菜花瓣大小QTL定位与候选基因研究数据

    2026年1月21日 30 85 49

    数据集概述 本数据集围绕油菜花瓣大小的遗传机制展开,通过全基因组关联分析(GWAS)和转录组比较,识别调控油菜花瓣大小的数量性状位点(QTL)和候选基因。包含588份油菜材料三年表型数据、17个显著关联SNP、11个差异表达基因及花瓣表皮细胞分析结果,为油菜花瓣发育遗传机制研究提供支撑。 文件详解 补充表格文件...
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  • Haplotype_Based_GWAS_小麦叶锈病抗性基因定位与预测数据

    2026年1月21日 30 84 25

    数据集概述 本数据集为小麦叶锈病抗性的单倍型全基因组关联分析(FH-GWAS)研究数据,包含133个亲本及1574个杂交后代的基因型与表型信息。通过对比SNP-GWAS与FH-GWAS方法,检测到25个和69个候选关联区域,FH-GWAS可提升抗性预测准确性至22.86%,数据集含3个文件,支持小麦叶锈病抗性育种的标记辅助选择研究。 文件详解...
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