数据集概述
本数据集来自小麦全基因组关联研究(GWAS),包含280份普通小麦基因型的表型与基因型数据。表型数据涵盖抽穗期、灌浆持续期、单穗粒数等6个产量及组分性状,在5个环境下测定;基因型数据基于Axiom小麦育种芯片的14,790个高质量SNP标记。数据用于定位调控小麦产量相关性状的基因组区域。
文件详解
- 文件名称:README_Genotype_PhenotypeFile_Information.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(Dr Gopalareddy Krishnappa及其机构)、文件生成时间(2022-07-20)等元数据说明
- 文件名称:Genotypic_Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于Axiom Wheat Breeder's Genotyping Array筛选后的14,790个高质量SNP标记数据,涵盖280份小麦基因型的基因分型信息
- 文件名称:Phenotypic_Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含6个产量及组分性状数据,涉及5个环境下的表型测定结果,性状包括单穗粒重(GWPS)、产量(GY)、株高(PH)、灌浆持续期(GFD)、抽穗期(DH)、单穗粒数(GNPS)
数据来源
All India Coordinated Research Project on Wheat and Barley
适用场景
- 小麦产量性状基因组定位: 分析调控抽穗期、单穗粒数等产量相关性状的基因组区域
- 作物分子育种研究: 利用SNP标记数据开发小麦产量性状的分子标记辅助选择工具
- 表型-基因型关联分析: 探究不同环境下小麦表型性状与基因型的关联模式
- 小麦遗传多样性研究: 基于SNP标记分析280份小麦基因型的遗传变异特征
- 农业环境适应性评估: 比较不同环境下小麦产量性状的表现差异,评估品种环境适应性