数据集概述
本数据集为基于加权Cox回归(WtCoxG)方法的全基因组关联研究(GWAS)数据,针对时间事件表型设计。包含7个文件,涉及模拟研究与英国生物银行(UK Biobank)真实数据分析结果,覆盖2型糖尿病、冠状动脉粥样硬化等表型,用于验证WtCoxG方法的统计功效与准确性。
文件详解
- CSV格式文件(共4个)
- 包含文件:SourceDataFig5.csv、SourceDataFig6.csv、SourceExtendData1.csv、SourceExtendData2.csv
- 字段映射介绍:通常包含染色体(CHR)、位置(POS)、变异ID(ID)、WtCoxG.UKB(英国生物银行数据结果)、WtCoxG.UKBL(英国生物银行扩展数据结果)、ADuLT(对比方法结果)等字段,记录不同方法的关联分析统计量
- XLSX格式文件(共3个)
- 包含文件:SourceDataFig2.xlsx、SourceDataFig3.xlsx、SourceDataFig4.xlsx
- 内容说明:为研究相关图表的源数据文件,具体字段需结合图表对应分析内容(如模拟研究参数、功效对比数据等)
数据来源
论文“Applying weighted Cox regression to genome-wide association studies of time-to-event phenotypes”
适用场景
- 基因组关联研究方法验证: 用于评估WtCoxG方法在时间事件表型GWAS中的统计功效与I类错误控制能力
- 复杂疾病遗传机制分析: 基于英国生物银行真实数据,研究2型糖尿病、冠状动脉粥样硬化等疾病的遗传关联
- 统计方法对比研究: 对比WtCoxG与ADuLT等现有方法在低频/罕见变异分析中的表现差异
- 生物信息学工具开发参考: 为时间事件表型的GWAS分析工具优化提供数据支持