数据集概述
本数据集来自全球孢子采样项目，包含2768份空气真菌DNA样本，采集自全球47个户外地点，覆盖两年时间。每份样本提取自24立方米空气，经保守生物信息学流程筛选后得到27954个物种水平操作分类单元（OTU），并附带有概率分类信息。数据可用于分析真菌群落的空间与季节变化，已验证年均温对群落组成有显著影响。
文件详解
- 核心数据文件（CSV格式）
metadata.csv：样本元数据，包含采样地点、日期、时间、测序深度、经纬度、温度等信息otu.table.csv：样本-物种OTU表，记录每个样本中各物种OTU的序列数taxonomy.csv：OTU分类信息，包含每个物种OTU的概率分类结果fungi_pseudophyla.csv：真菌假门ASV匹配信息，包含参考序列及分类信息nonfungi_pseudophyla.csv：非真菌假门ASV匹配信息，包含ASV编号、假门分类、物种匹配等字段- R数据文件（RData格式）
allData.RData：整合前三个CSV文件的R数据对象site_data.RData：采样地点相关数据sample_data.RData：样本相关数据- 分析脚本（R格式）
S2_download_GBIF_data.R、S3_make_GBIF_maps.R、S4_compare_to_GBIF.R等：共6个R脚本，用于数据下载、可视化及分析- 压缩包文件
bioinformatics_pipeline_outputs.zip：生物信息学流程输出结果压缩包GSSP-data_v1.0.tar.gz：项目数据完整压缩包protaxFungi.tgz：真菌分类数据库压缩包
数据来源
Global Spore Sampling Project
适用场景
- 全球真菌生物多样性研究：分析不同地理区域空气真菌群落的物种组成与多样性
- 气候与真菌群落关系研究：探究年均温等气候因素对真菌群落结构的影响
- 生物地理分布模式分析：解析真菌物种的空间分布规律及季节变化特征
- 空气微生物监测应用：开发基于空气孢子采样的真菌多样性监测技术
- 生物信息学方法验证：测试保守序列筛选流程在真菌多样性研究中的应用效果
- 全球变化生态学研究：评估气候变化对全球真菌群落动态的潜在影响
