数据集概述
本数据集包含33株犬口腔细菌分离株的基因组数据，以及16S rRNA基因分析、平均核苷酸一致性（ANI）分析、标记基因系统发育分析等分类方法的结果文件。通过对比16S rRNA基因测序、手动多方法整合分类与Genome Taxonomy Database（GTDB）自动化分类的结果，验证基因组自动化分类方法的有效性，总计包含41个文件。
文件详解
- 16S rRNA基因系统发育文件
- 文件名称：遵循
[属名]_16S.nexml或[属名]_16S_type.nexml模式（例如：Leucobacter_16S.nexml、Streptococcus_16S_type.nexml）
- 文件格式：NEXML
- 字段映射介绍：包含细菌16S rRNA基因序列的系统发育分析结果，用于基于16S rRNA基因的分类学定位
- 平均核苷酸一致性（ANI）分析文件
- 文件名称：遵循
[属名(可选旧属名)].ANI.xlsx模式（例如：Bacteroides(Prevotella).ANI.xlsx、Prevotella.ANI.xlsx）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含不同细菌分离株之间的平均核苷酸一致性计算结果，用于基因组水平的物种分类验证
- 全基因组测序（WGS）标记基因系统发育文件
- 文件名称：Erysipelotrichaceae_WGS.nexml
- 文件格式：NEXML
- 字段映射介绍：包含Erysipelotrichaceae科细菌基于全基因组测序标记基因的系统发育分析结果
数据来源
论文“Genomes From Bacteria Associated with the Canine Oral Cavity: a Test Case for Automated Genome-Based Taxonomic Assignment”
适用场景
- 微生物分类方法验证: 对比16S rRNA基因测序、ANI分析与GTDB自动化分类的结果一致性，评估不同分类方法的准确性
- 犬口腔微生物组研究: 分析犬口腔细菌的基因组特征及分类学地位，为宠物口腔健康研究提供数据支持
- 自动化分类工具评估: 验证GTDB等基因组自动化分类工具在细菌分类中的实用性与效率
- 细菌分类学修订研究: 基于多方法分类结果的差异，探讨GTDB提出的分类学变更的合理性
