找到64个数据集

标签: 16S rRNA基因

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  • 亚洲叶蛙属16S_rRNA基因未校正遗传距离数据_2025年

    2026年2月8日 30 177 61

    数据集概述 本数据集为亚洲叶蛙属(Leptobrachella)物种16S rRNA基因序列的未校正遗传距离数据,是相关系统学研究的补充材料,用于反映该属物种间的分子遗传差异,为物种分化和新种描述提供分子依据。 文件详解 文件名称:oo_1242043.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含亚洲叶蛙属不同物种间基于16S...
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  • Mdaini_2024_地中海土壤特性与微生物学数据

    2026年1月31日 30 17 4

    数据集概述 本数据集聚焦半干旱地中海气候下灌溉果园的表土(0-10厘米)与底土(30-50厘米),探究土壤理化特性与微生物群落的关联。通过高通量16S rRNA基因和ITS1区域扩增子测序,分析不同土层的细菌和真菌群落,同时记录表土因灌溉导致的高盐度现象。 文件详解 文件名称:Mdaini et al. 2024. Soil depth...
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  • 孟加拉陆生吸血水蛭的宿主DNA与相机陷阱生物多样性监测数据

    2026年1月30日 30 157 10

    数据集概述 本数据集包含孟加拉东北部热带雨林中陆生吸血水蛭宿主DNA测序数据与相机陷阱监测数据,用于对比两种方法在哺乳动物生物多样性监测中的效果。数据来自200条水蛭的16S rRNA基因测序结果及1334个相机陷阱夜的监测记录,旨在为热带生物多样性长期监测方案提供技术参考。 文件详解 文件名称:Bangladesh_leech_data.xlsx...
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  • GTDB_Based_犬口腔细菌基因组分类方法对比测试数据

    2026年1月30日 30 108 102

    数据集概述 本数据集包含33株犬口腔细菌分离株的基因组数据,以及16S rRNA基因分析、平均核苷酸一致性(ANI)分析、标记基因系统发育分析等分类方法的结果文件。通过对比16S rRNA基因测序、手动多方法整合分类与Genome Taxonomy Database(GTDB)自动化分类的结果,验证基因组自动化分类方法的有效性,总计包含41个文件。...
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  • Euryarchaeota_未培养分支系统发育生态学研究数据

    2026年1月29日 30 210 178

    数据集概述 本数据集围绕广古菌门(Euryarchaeota)中广泛分布但未培养的分支展开系统发育生态学研究,整合了Lake Dagow Sediment(LDS)和Rice Cluster-V(RC-V)两个嗜温分支的16S rRNA基因序列,分析其环境分布、进化历史及遗传多样性,揭示环境适应性与生态分化的关系。 文件详解...
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  • HiBC人类肠道细菌16S_rRNA基因序列数据20240620

    2026年1月28日 30 128 24

    数据集概述 本数据集包含人类肠道细菌集合(HiBC)中分离菌株的16S rRNA基因序列,涵盖已知细菌及待分类命名的新物种菌株。序列以FASTA核苷酸格式存储,通过Sanger测序技术或基因组序列提取获得,为微生物研究社区提供标准化基因序列资源。 文件详解 文件名称:HiBC_16S_rRNA_gene_sequences_20240620.zip...
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  • ATCC_Even_Mock_Based_微生物组分析参考序列数据

    2026年1月27日 30 65 46

    数据集概述 本数据集包含ATCC Even Mock Community的16S rRNA基因参考序列及相关辅助文件,旨在支持微生物组分析中的模拟群落(mock community)质控与偏差评估。数据涵盖适用于DADA2分析工具的参考序列文件、数据库文件、物种信息表及流程复现代码,共9个文件,可用于微生物组实验中阳性对照的物种分类注释与偏差验证。...
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  • SAFE_Based_婆罗洲不同生境哺乳动物多样性水蛭血液iDNA数据

    2026年1月26日 30 21 10

    数据集概述 本数据集包含2016年在婆罗洲SAFE项目及DVCA区域采集的水蛭血液iDNA数据,用于分析不同生境的哺乳动物多样性差异。通过元条形码技术提取并扩增哺乳动物16S rRNA基因,结合微气候数据探究其对哺乳动物检测的影响,包含未过滤分类分配、检测记录及微气候变量三类表格。 文件详解...
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  • Long_term_Based_磷限制水稻土微生物功能多样性研究数据

    2026年1月23日 30 171 141

    数据集概述 本数据集为长期平衡施肥对磷限制水稻土微生物功能多样性影响的研究数据,包含22年不同施肥处理(空白、单氮、氮磷、氮钾、氮磷钾)下的土壤微生物组成及功能基因结构数据,采用16S rRNA基因焦磷酸测序和GeoChip 4.0功能基因芯片技术分析,共4个文件。 文件详解 otutable.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • JGI_IMG_放线菌抗生素抗性基因与16S_rRNA基因系统发育相关性研究数据

    2026年1月19日 30 175 43

    数据集概述 本数据集围绕放线菌中抗生素抗性基因(erm、ABC转运蛋白基因)与16S rRNA基因的系统发育相关性展开,包含90株分离自不同土壤环境的放线菌菌株实验数据,以及JGI_IMG数据库中246株含ABC转运蛋白基因、31株含erm基因菌株的生物信息学分析数据,用于探究抗性基因进化与土壤环境的关联。 文件详解 文件名称:Fig_1.zip...
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  • 扩展数据图2_27_基于16S_rRNA基因分析的生物信息学预测样本地理信息数据

    2026年1月19日 30 11 7

    数据集概述 本数据集包含基于16S rRNA基因分析预测的四种PE降解细菌样本的地理信息,通过Extended Data Fig.2-27.xlsx文件呈现,为研究PE降解细菌的地理分布提供数据支持。 文件详解 文件名称:Extended Data Fig.2-27.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • New_Zealand_Geothermal_Based嗜热甲烷氧化微生物分析数据

    2026年1月18日 30 71 38

    数据集概述 本数据集为新西兰陶波火山带地热田嗜热甲烷氧化研究的处理数据,包含土壤或沉积物样本的甲烷氧化量化结果、16S rRNA基因测序相关的微生物分类单元数据,共3个文件,用于支持相关学术论文的分析。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT 字段映射介绍:说明数据集背景,包括样本来源(新西兰陶波火山带地热田)、研究内容(甲烷氧化量化、16S...
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  • Soil_Microbiome_Based热带森林与油棕农业土壤微生物组研究数据

    2026年1月15日 30 80 46

    数据集概述 本数据集通过16S rRNA基因和宏基因组测序,对比婆罗洲沙巴地区未砍伐、一次砍伐、二次砍伐雨林及油棕种植园的土壤生物群组成与功能属性,探究土地利用变化对土壤微生物组的影响。包含四类土壤相关数据文件,共四个文件。 文件详解 文件名称:Soil chemical variables.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • ZooKeys_补充材料_1_Leptobrachella新种遗传分析数据2020

    2026年1月14日 30 108 29

    数据集概述 本数据集为论文的补充材料1,包含亚洲叶凋蟾属(Leptobrachella)物种间基于16S rRNA基因的未校正p距离数据,用于支持新物种分类学研究,是两栖动物系统发育分析的关键遗传信息资源。 文件详解 文件名称:oo_424105.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含Table...
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  • Pseudomonas_veronii_亚磷酸盐作为合成土壤细菌群落工程生态位研究数据

    2026年1月14日 30 95 1

    数据集概述 本数据集包含论文“Phosphite as an Engineered Niche for Pseudomonas veronii in a Synthetic Soil Bacterial Community”的源数据与分析文件,涉及16S...
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  • 亚洲落叶蛙Leptobrachella的16S_rRNA基因未校正遗传距离数据_补充材料1

    2026年1月12日 30 176 99

    数据集概述 本数据集为论文的补充材料1,包含亚洲叶凋蟾蜍属(Leptobrachella)物种间基于16S rRNA基因的未校正遗传距离(p-distance)数据,用于支持新物种的分类学研究,明确物种间的遗传分化程度,共含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_515461.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Burkholderia_Source_广头蝽物种与环境获取细菌共生体伙伴关联研究数据_原始分析文件

    2026年1月3日 30 184 58

    数据集概述 本数据集围绕四种同域分布广头蝽物种与环境获取细菌共生体的伙伴关联展开,通过16S rRNA基因测序等技术分析49个个体共生器官内的细菌种群,重点探究伯克霍尔德菌的共生特异性、功能作用及环境获取机制,包含7项核心分析对应的原始数据与脚本文件。 文件详解...
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  • REFLOW_Fertilizers_Based_不同磷酸盐形态施用后土壤微生物变化特征数据_待发布

    2026年1月4日 30 110 102

    数据集概述 本数据集记录了REFLOW肥料中不同磷酸盐形态对土壤微生物的影响,包括微生物活性、组成及生物量的变化结果。数据集包含3个文件,覆盖呼吸作用数据、微生物相关指标数据及说明文档,为研究肥料中磷形态对土壤微生物群落的作用提供支持。 文件详解 文件名称:Index.docx 文件格式:DOCX...
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  • Porites_Identification_Based_印度洋西部多孔鹿角珊瑚白斑综合征病原菌鉴定数据

    2025年12月31日 30 146 22

    数据集概述 本数据集为印度洋西部多孔鹿角珊瑚白斑综合征(PWPS)病原菌鉴定研究相关数据,包含16S rRNA基因、pyrH基因等的序列文件、系统发育树文件、细菌培养及感染试验相关数据文件,用于支持PWPS病原菌的分离、鉴定及温度依赖性分析。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式,共5个) 文件名称:PWPS bacterial...
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  • RootWayS_Based_德国三种土壤干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落qPCR定量数据_2023

    2025年12月31日 30 170 125

    数据集概述 本数据集为德国三种土壤中,干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落的qPCR定量数据。通过SYBR® Green法qPCR检测16S rRNA基因拷贝数,使用大肠杆菌V3区域扩增子作标准品,样本设三次重复,记录反应条件及效率,包含元数据、原始数据及分析文件共27份。 文件详解 元数据文件...
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