数据集概述
本数据集包含论文“Phosphite as an Engineered Niche for Pseudomonas veronii in a Synthetic Soil Bacterial Community”的源数据与分析文件，涉及16S rRNA基因扩增子测序丰度表、甲苯定量数据、CFU计数等内容，配套R脚本用于统计分析与图表生成，总计34个文件，支持土壤细菌群落生态位相关研究。
文件详解
- 数据文件（共14个）
- 16S测序丰度文件：
abund.csv（CSV格式）、abund_se.csv（CSV格式）、abund_cfu.csv（CSV格式）、abund_cfu_se.csv（CSV格式），包含样本ID、物种相对丰度/绝对丰度等变量
- 甲苯定量文件：
tolquant_1.csv（CSV格式）、tolse_quant.csv（CSV格式），包含样本ID、甲苯通道、保留时间、甲苯百分比等变量
- CFU计数文件：
bottles stable CFU counts.xlsx（XLSX格式）、bottles growing CFU counts.xlsx（XLSX格式）、Growth_curves_SE.csv（CSV格式），记录不同条件下的CFU计数数据
- 样本信息文件：
Bottle Key.xlsx（XLSX格式），提供采样瓶编号与实验条件的对应关系
- 文档文件（共8个）
- README文件：
tolquant_README.txt、abund_cfu_se_README.txt等（TXT格式），分别说明对应数据文件的来源、变量定义与实验方法
- 代码文件（共12个）
- R脚本：
NMDS_CB_v2.R、pt_comparisons_clean_v2.R等（.R格式），包含NMDS分析、统计比较、甲苯定量分析等数据处理与可视化代码
数据来源
论文“Phosphite as an Engineered Niche for Pseudomonas veronii in a Synthetic Soil Bacterial Community” by Bailey et al.
适用场景
- 微生物生态位工程研究：分析亚磷酸盐对Pseudomonas veronii在合成土壤细菌群落中生态位构建的影响
- 土壤细菌群落动态分析：利用16S rRNA基因扩增子测序数据研究群落组成与相对丰度变化
- 甲苯降解微生物功能研究：结合甲苯定量数据与CFU计数，探究细菌群落的甲苯降解能力
- 微生物实验数据分析：通过配套R脚本复现统计分析、NMDS排序等实验结果，支持相关研究验证与拓展
