数据集概述
本数据集包含2016年在婆罗洲SAFE项目及DVCA区域采集的水蛭血液iDNA数据,用于分析不同生境的哺乳动物多样性差异。通过元条形码技术提取并扩增哺乳动物16S rRNA基因,结合微气候数据探究其对哺乳动物检测的影响,包含未过滤分类分配、检测记录及微气候变量三类表格。
文件详解
- 文件名称:Drinkwater2020-iDNA_diversity3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 工作表及字段介绍:
- 工作表ecoTAG_output_raw(未过滤分类分配):含id、site、hab、count、best_identity、family、family_name、genus、genus_name、order、order_name、species、species_name、Assigned_name、sequence共15个字段,记录未过滤的iDNA序列分类匹配结果
- 工作表detections(各样本池哺乳动物检测记录):含pool、site、leeches、habitat及15个哺乳动物类群(如Arctogalidia、Elephas等)的检测计数字段,共19个字段,记录过滤后的物种检测矩阵
- 工作表microclimate(微气候变量):含Code、site、T_max_raster、T_mean_raster、VPD_max_raster、VPD_mean_raster共6个字段,记录各点位的温度及蒸气压 deficit数据
数据来源
Drinkwater et al. (2020) 提交至Molecular Ecology的研究数据,隶属于SAFE研究项目
适用场景
- 生物多样性监测:分析婆罗洲不同生境的哺乳动物多样性差异
- 环境DNA技术应用:探究水蛭血液iDNA在陆生哺乳动物监测中的有效性
- 微气候影响研究:评估温度、蒸气压 deficit等微气候因素对哺乳动物检测的影响
- 森林破碎化生态效应分析:结合SAFE项目背景,研究雨林破碎化对哺乳动物群落的影响
- 分类学与分子生态学研究:利用未过滤序列数据开展物种分类及分子生态分析