数据集概述
本数据集为果蝇实验渐渗研究数据，围绕D. flavomontana与D. montana两个物种的种间基因流展开，通过回交实验结合基因组测序，分析染色体倒位和X染色体不相容位点对合子后生殖隔离的影响，识别限制或增加基因渐渗的染色体区域，共包含六个相关文件。
文件详解
- README_file.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明各文件内容，如表型数据文件包含杂交种育性和繁殖力信息，参考基因组文件对应物种基因组，等位基因频率文件对应不同参考基因组的回交池等位基因频率
- D_flavomontana.ref_genome.unmasked.fa.gz
- 文件格式：GZ（压缩FASTA）
- 字段映射介绍：D. flavomontana物种的未掩蔽参考基因组序列文件
- Experimental_introgression_phenotypic_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含实验中杂交种的育性、繁殖力等表型数据字段
- experimental_introgression_allele_frequencies.D_montana.ref_genome.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：以D. montana为参考基因组时，第二代回交池的等位基因频率数据，包含染色体（如X_chromosome）、基因座位置及频率数值等字段
- experimental_introgression_allele_frequencies.D_flavomontana.ref_genome.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：以D. flavomontana为参考基因组时，第二代回交池的等位基因频率数据，包含染色体、基因座位置及频率数值等字段
- D_montana.ref_genome.unmasked.fa.gz
- 文件格式：GZ（压缩FASTA）
- 字段映射介绍：D. montana物种的未掩蔽参考基因组序列文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析染色体倒位和X染色体不相容位点在物种生殖隔离中的作用机制
- 基因组渐渗分析：探究种间基因流限制或增加的染色体区域特征
- 表型与基因型关联研究：结合表型数据与等位基因频率，解析育性相关的遗传基础
- 物种形成机制验证：验证染色体结构变异对合子后生殖隔离的影响假说
