数据集概述
本数据集记录东非慈鲷饮食转变期间的肠道菌群动态,涵盖坦噶尼喀湖Perissodini族5种慈鲷(从食浮游动物向食鱼鳞转变)及外类群杂食性河流物种Astatotilapia burtoni的肠道菌群结构,通过16S rRNA标记分析菌群组成,为研究宿主系统发育与生态适应对肠道菌群的影响提供数据支持。
文件详解
- V34_OTU_biom_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基于V34 16S rRNA标记的操作分类单元(OTU)生物量表格,记录样本中各OTU的相对丰度等菌群组成数据
- V34_OTUs_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:V34 16S rRNA标记对应的OTU序列比对文件,存储各OTU的核苷酸序列信息
- V12_OTUs_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:V12 16S rRNA标记对应的OTU序列比对文件,包含各OTU的核苷酸序列数据
- V12_OTU_biom_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于V12 16S rRNA标记的OTU生物量表格,记录样本中各OTU的相对丰度等菌群组成信息
适用场景
- 鱼类肠道微生物组研究:分析东非慈鲷肠道菌群的组成、多样性及动态变化特征
- 宿主饮食适应机制探究:研究慈鲷饮食转变过程中肠道菌群的响应与代谢功能变化
- 微生物-宿主协同进化分析:探讨宿主系统发育关系与肠道菌群结构的关联性
- 水生生态系统微生物生态研究:为淡水鱼类肠道菌群与生态位适应的关系提供数据支撑