固着型多里姆虫分子系统发育数据集

数据集概述

本数据集包含固着型多里姆虫(Dolium sedentarium)的首次分子测序数据,基于单细胞转录组学技术获得。数据涵盖SSU rDNA及多基因系统发育分析结果,确认其为瓣滴虫目内独立分支,为研究眼虫类早期演化提供关键分子依据。

文件详解

  • README.md: 文档格式,补充说明手稿相关的数据集背景、内容及使用说明。
  • cell_images.zip: 压缩文件,包含多里姆虫的细胞图像文件。
  • multigene.zip: 压缩文件,包含多基因系统发育分析相关的比对文件和树文件。
  • Dolium_sedentarium_SMS11_transcripts.pep: 蛋白序列格式,多里姆虫SMS11株的预测蛋白序列文件。
  • Dolium_sedentarium_SMS11_transcripts.fasta: 核酸序列格式,多里姆虫SMS11株的转录本序列文件。
  • multiqc-data.zip: 压缩文件,包含MultiQC分析的原始数据文件。
  • multiqc_report.html: HTML格式,MultiQC生成的分析报告文件。
  • SSU.zip: 压缩文件,包含SSU rDNA序列的比对文件和树文件。

适用场景

  • 眼虫类演化研究:分析多里姆虫在瓣滴虫目中的系统发育位置,探究眼虫类早期分支特征。
  • 分子系统学分析:利用SSU rDNA及多基因数据构建眼虫类系统发育树,验证形态分类假说。
  • 单细胞转录组学应用:研究稀有原生生物的基因表达谱,探索固着型眼虫的分子适应机制。
  • 原生生物多样性研究:补充热带底栖环境中稀有眼虫类群的分子数据,完善眼虫类分子数据库。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 285.43 MiB
最后更新 2025年12月19日
创建于 2025年12月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。