数据集概述
本数据集包含用于分析巴西东北部季节性干旱热带森林(Caatinga)爬行动物群落同步种群变化的遗传数据,涉及七种有鳞目动物和四种两栖动物。数据通过分层近似贝叶斯计算(hABC)模型,验证更新世干旱增加对相关物种多样化的影响,支持Caatinga在晚更新世扩张的结论。
文件详解
- 遗传序列文件(.fas格式,10个文件)
- 文件名称示例:A_ocellifera_12S.fas、V_multiscutata_cytb.fas、P_diplolister.fas等
- 文件格式:.fas
- 字段映射介绍:包含不同物种的单基因或串联基因序列数据,基因类型涵盖12S、cytb、ND2、COI、16S等
- 综合数据文件(all_data.xlsx)
- 文件名称:all_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:整合所有物种遗传数据及分析相关的元数据
- 额外基因序列文件(.fasta格式,1个文件)
- 文件名称示例:P_nattereri_COI.fasta
- 文件格式:.fasta
- 字段映射介绍:包含特定物种的COI基因序列数据
数据来源
论文“Estimating synchronous demographic changes across populations using hABC and its application for a herpetological community from northeastern Brazil”
适用场景
- 种群动态分析: 研究晚更新世巴西东北部爬行动物群落的同步种群扩张过程
- 生物地理学研究: 验证Caatinga生物群落在更新世的扩张假说及对物种分布的影响
- 遗传多样性评估: 分析干旱适应性物种的遗传变异特征及群落形成机制
- 气候变化与物种响应研究: 探讨第四纪气候周期对热带干旱森林物种演化的影响
- 保护生物学应用: 为干旱适应性物种的保护策略制定提供历史种群动态依据