数据集概述
本数据集是Harding等人关于亨廷顿蛋白（HTT）结构研究论文的补充数据，包含11个文件，涵盖多序列比对、冷冻电镜图谱、小角X射线散射（SAXS）谱、交联质谱（XL-MS）数据及蛋白复合物集合模型等内容，支撑HTT结构由HAP40调控及多聚谷氨酰胺扩展与外显子1特异性互作的研究结论。
文件详解
- Supplementary Data 1
- 文件名称：Supplementary_Data_1_HTT_MSA.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：亨廷顿蛋白（HTT）多序列比对数据，用于Consurf分析
- Supplementary Data 2
- 文件名称：Supplementary_Data_2_HAP40_MSA.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：HAP40蛋白多序列比对数据，用于Consurf分析
- Supplementary Data 3
- 文件名称：Supplementary_Data_3_Apo_HTT_CryoEM.mrc
- 文件格式：MRC
- 字段映射介绍：无配体亨廷顿蛋白（Apo HTT）冷冻电镜图谱数据
- Supplementary Data 4
- 文件名称：Supplementary_Data_4_Q23_SAXS.dat
- 文件格式：DAT
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Q23（23个谷氨酰胺）复合物正则化小角X射线散射谱
- Supplementary Data 5
- 文件名称：Supplementary_Data_5_Q54_SAXS.dat
- 文件格式：DAT
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Q54（54个谷氨酰胺）复合物正则化小角X射线散射谱
- Supplementary Data 6
- 文件名称：Supplementary_Data_6_DelEx1_SAXS.dat
- 文件格式：DAT
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Δexon 1（缺失外显子1）复合物正则化小角X射线散射谱
- Supplementary Data 7
- 文件名称：Supplementary_Data_7_XLMS.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：交联质谱（XL-MS）数据，记录蛋白间交联信息
- Supplementary Data 8
- 文件名称：Supplementary_Data_8_ensemble_weightings.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：HTT-HAP40复合物集合模型权重数据，包含模型文件名称及对应权重值
- Supplementary Data 9
- 文件名称：Supplementary_Data_9_Q23_ensemble.cif
- 文件格式：CIF
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Q23复合物集合模型结构数据
- Supplementary Data 10
- 文件名称：Supplementary_Data_10_Q54_ensemble.cif
- 文件格式：CIF
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Q54复合物集合模型结构数据
- Supplementary Data 11
- 文件名称：Supplementary_Data_11_DelEx1_ensemble.cif
- 文件格式：CIF
- 字段映射介绍：HTT-HAP40 Δexon 1复合物集合模型结构数据
数据来源
Harding等人的论文“Huntingtin structure is orchestrated by HAP40 and shows a polyglutamine expansion-specific interaction with exon 1”
适用场景
- 亨廷顿病分子机制研究：分析HTT结构特征及HAP40对其的调控作用，探究多聚谷氨酰胺扩展的致病机制
- 蛋白质互作分析：利用XL-MS数据研究HTT与HAP40的相互作用位点及模式
- 结构生物学验证：通过冷冻电镜图谱和SAXS谱验证HTT-HAP40复合物的三维结构
- 计算生物学建模：基于集合模型权重数据构建更精准的HTT-HAP40复合物结构模型
- 序列保守性分析：通过多序列比对数据研究HTT和HAP40的序列保守区域及功能相关性
