数据集概述
本数据集包含通过全基因组SNP分型获得的夏威夷芋头(Colocasia esculenta)相关数据,涵盖70份来自夏威夷、南太平洋、帕劳及亚洲大陆的芋头样本,涉及系统发育关系、育种意义及栽培历史研究,包含2个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:HawaiianTaro_SNP.vcf.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含全基因组SNP标记的VCF格式文件,记录70份芋头样本的单核苷酸多态性位点信息,用于系统发育分析和群体结构研究。
- 文件名称:HawaiianTaro_SNP.fas.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含基于SNP数据的序列文件,支持系统发育树构建、遗传多样性分析等遗传学研究应用。
数据来源
论文“Phylogenetic relationships, breeding implications, and cultivation history of Hawaiian taro (Colocasia esculenta) through genome-wide SNP genotyping”
适用场景
- 植物系统发育研究: 分析夏威夷芋头与太平洋及亚洲大陆芋头的亲缘关系,揭示其进化路径。
- 芋头育种应用: 利用SNP标记开发辅助育种工具,筛选抗病性等目标性状相关的遗传位点。
- 农业栽培历史研究: 探究夏威夷芋头的栽培起源及早期波利尼西亚移民的芋头传播路径。
- 遗传多样性分析: 评估不同地理来源芋头样本的遗传变异水平,为种质资源保护提供依据。