HawaiianTaro_SNP_Based夏威夷芋头基因组系统发育与育种数据

数据集概述

本数据集包含通过全基因组SNP分型获得的夏威夷芋头(Colocasia esculenta)相关数据,涵盖70份来自夏威夷、南太平洋、帕劳及亚洲大陆的芋头样本,涉及系统发育关系、育种意义及栽培历史研究,包含2个压缩文件。

文件详解

  • 文件名称:HawaiianTaro_SNP.vcf.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含全基因组SNP标记的VCF格式文件,记录70份芋头样本的单核苷酸多态性位点信息,用于系统发育分析和群体结构研究。
  • 文件名称:HawaiianTaro_SNP.fas.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含基于SNP数据的序列文件,支持系统发育树构建、遗传多样性分析等遗传学研究应用。

数据来源

论文“Phylogenetic relationships, breeding implications, and cultivation history of Hawaiian taro (Colocasia esculenta) through genome-wide SNP genotyping”

适用场景

  • 植物系统发育研究: 分析夏威夷芋头与太平洋及亚洲大陆芋头的亲缘关系,揭示其进化路径。
  • 芋头育种应用: 利用SNP标记开发辅助育种工具,筛选抗病性等目标性状相关的遗传位点。
  • 农业栽培历史研究: 探究夏威夷芋头的栽培起源及早期波利尼西亚移民的芋头传播路径。
  • 遗传多样性分析: 评估不同地理来源芋头样本的遗传变异水平,为种质资源保护提供依据。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.44 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
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