河流生物膜微生物多样性测序技术比较分析数据集

数据集概述

本数据集为论文《Unlocking River Biofilm Microbial Diversity: Comparative Analysis of Sequencing Technologies》的原始数据,包含EA PacBio样本元数据、合并的长读长与短读长16S OTU及分类表压缩包,以及叶绿体过滤后的16S分析脚本,为比较测序技术对河流生物膜微生物多样性研究的影响提供数据支持。

文件详解

  • EA PacBio samples metadata.xlsx:Excel格式文件,包含EA PacBio样本的元数据信息
  • merged_LR_SR_16s_OTUs_and_taxa_table.zip:压缩包文件,包含合并的长读长(LR)与短读长(SR)16S OTU表及分类表数据,分类表基于SILVA v138.1参考数据库和DADA2生成
  • Final 16s analysis script chloroplast filtered.Rmd:R Markdown格式文件,为叶绿体过滤后的16S分析脚本

适用场景

  • 微生物生态学研究:分析河流生物膜微生物多样性特征
  • 测序技术比较研究:评估不同测序技术(长读长与短读长)在微生物多样性分析中的应用效果
  • 生物信息学方法验证:验证基于SILVA数据库和DADA2的分类表构建方法的可靠性
  • 环境微生物监测:探索河流生态系统中微生物群落结构与环境因子的关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 11.67 MiB
最后更新 2025年12月9日
创建于 2025年12月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。