数据集概述
本数据集包含2023年波罗的海格但斯克湾沿岸站位两次高频采样获取的9份文件，覆盖环境变量、生物参数及真核微生物多样性数据，聚焦浮游植物水华期微生物食物网的动态变化与结构特征，为海洋生态研究提供多维度数据支持。
文件详解
- 环境与生物数据文件
- 文件名称：
HFS-Baltic-environmentalabundanceandsize.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：含4个工作表，“Parameters-Data”定义“Data”表的变量、单位、方法；“Data”为宽格式环境与生物数据；“Parameter-Size”定义“HNF细胞大小”相关参数；“Size”为长格式异养 nanoflagellates（HNF）细胞大小数据。
- Illumina测序丰度文件
- 文件名称：
Illumina-short-alleuks-Khanetal2025.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：Phyloseq对象，包含18S rRNA基因V6-V8片段Illumina测序的真核微生物ASV绝对丰度（样本稀疏至25378条reads）。
- Illumina测序相对丰度文件
- 文件名称：
Illumina-short-aHNF-percent-Khanetal2025.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：Phyloseq对象，包含特定真核类群（如Kathablepharidacea、MAST-2等）的ASV相对丰度（占总真核reads的百分比）。
- PacBio长扩增子ASV表文件
- 文件名称：
LongAmpliconsASVtable.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：含4个工作表，“Parameters-Table”定义“Table”表参数；“Table”为宽格式PacBio测序真核ASV丰度；“Parameter-samplecodes”定义样本编码参数；“samplecodes”为样本元数据。
- 系统发育树与比对文件
- 文件名称：
KAT-fasta.clipkit.treefile、KAT-alignment.fasta、MAST-fasta.clipkit.treefile、MAST-2.alignment.fasta
- 文件格式：TREEFILE、FASTA
- 字段映射介绍：包含Kathablepharidacea和MAST-2类群的18S-28S rRNA操纵子序列比对结果（FASTA）及基于比对构建的最大似然系统发育树（TREEFILE）。
适用场景
- 海洋微生物生态学研究：分析浮游植物水华期微生物食物网的结构组成与动态变化规律。
- 环境因子关联分析：探究环境变量（如营养盐、水文参数）与微生物群落结构的相关性。
- 真核微生物多样性研究：基于Illumina和PacBio测序数据解析特定类群（如MAST、Kathablepharidacea）的多样性特征。
- 系统发育分析：利用比对序列与系统发育树开展目标微生物类群的进化关系研究。
- 生态模型构建：为浮游植物水华期微生物食物网的动态模型提供实测数据支撑。
