数据集概述
本数据集为海马（Hippocampus abdominalis）跨塔斯曼海遗传连通性研究的数据，包含42个文件，涉及线粒体DNA、微卫星等多基因座遗传数据及分析输入文件，用于研究该物种在澳大利亚东南部、塔斯马尼亚和新西兰沿海区域的历史迁徙、扩散模式及种群遗传结构。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：解释所有处理数据和输入文件的内容，包含各数据集对应的软件及版本说明
- 遗传数据输入文件
- 文件名称样本：input_AD-NB.txt、input_AD-CC.txt、STRUCTURE_input_final.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：用于遗传分析软件的输入文件，包含种群分组、基因型数据等信息
- 线粒体DNA数据文件
- 文件名称样本：Habd_mtCR_all.arp、mtCR_Habd.fasta、hippocampuscytb071718.phy
- 文件格式：ARP、FASTA、PHY
- 字段映射介绍：包含线粒体控制区（mtCR）、细胞色素b（cytb）的序列数据及用于Arlequin软件的输入格式
- 微卫星数据文件
- 文件名称样本：Habd_msats_Arlequin.arp
- 文件格式：ARP
- 字段映射介绍：微卫星标记的基因型数据，用于Arlequin软件进行种群遗传分析
- 地理距离与Mantel检验文件
- 文件名称样本：geodistmantelAU.csv、msatmantelDestAU.csv、msatmantelDestNZ.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含地理距离矩阵、遗传距离矩阵，用于Mantel检验分析地理隔离与遗传分化的关系
- 统计分析结果文件
- 文件名称样本：EvannoK_deltaK.xlsx、HabdGenAlEx_input.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含STRUCTURE分析的K值确定结果、用于GenAlEx软件的输入数据等
- 系统发育分析文件
- 文件名称样本：mtCR_Habd.phy.graph
- 文件格式：GRAPH
- 字段映射介绍：线粒体控制区序列构建的系统发育树相关文件
数据来源
论文“Navigating the southern seas with small fins: Genetic connectivity of seahorses (Hippocampus abdominalis) across the Tasman Sea”
适用场景
- 海洋生物种群遗传结构研究：分析海马在塔斯曼海区域的种群分化、遗传多样性及连通性
- 生物地理扩散模式分析：探究该物种跨塔斯曼海的历史迁徙路径及当代基因交流方向
- 进化生物学研究：研究隔离种群的独立演化轨迹及二次基因交换对物种系统发育的影响
- 海洋保护策略制定：为海马物种的保护单元划分、栖息地保护提供遗传数据支持
