数据集概述
本数据集基于杂交小鼠多样性面板(HMDP)的99个近交系小鼠,通过RNA-Seq技术表征下丘脑转录组,包含蛋白质组分析支持的新转录本、新非编码RNA,以及局部和反式表达数量性状位点(eQTL)、可变剪接事件,可关联约150种代谢和心血管性状。
文件详解
- 文件名称:FileS2_ExpressionQTL.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含下丘脑转录组相关数据,具体内容未提供预览,推测涵盖基因表达谱、eQTL定位结果、可变剪接事件数据及性状关联分析结果等。
数据来源
论文“Hypothalamic transcriptomes of 99 mouse strains reveal trans eQTL hotspots, splicing QTLs and novel non-coding genes”
适用场景
- 下丘脑基因表达遗传调控研究:分析局部和反式eQTL对基因表达的影响,探索eQTL热点区域功能。
- 非编码RNA功能研究:挖掘新非编码RNA的潜在作用及与代谢、心血管性状的关联。
- 可变剪接遗传机制分析:探究遗传变异对下丘脑基因可变剪接事件的调控模式。
- 代谢与心血管性状分子机制研究:关联转录组数据与代谢、心血管表型,揭示下丘脑介导的生理功能遗传基础。