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EoRNA_Based_大麦基因转录本丰度数据库数据
2026年1月31日 30 57 27
数据集概述 本数据集基于大麦参考转录本数据集BaRTv1.0，整合22项RNA-seq实验的843个样本数据，构建大麦基因表达数据库EoRNA。包含基因和转录本丰度（TPM值）、基因模型信息，支持通过基因名或BLAST查询，可用于分析品种、组织及条件特异性表达与可变剪接，提供可视化与数据提取功能。 文件详解...
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RNA_seq_Based_转录组组装与差异表达量化策略评估数据
2026年1月28日 30 110 94
数据集概述 本数据集为RNA-seq实验转录组组装与差异表达量化的模拟评估数据，包含16个文件，涵盖脚本、代码及压缩包。用于探究转录组特征、技术处理及生物信息学流程对转录组质量和差异表达推断的影响，为RNA-seq实验设计与分析提供方法学参考。 文件详解 代码脚本文件...
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ScISOr_Seq_Based三刺鱼单细胞测序基因组注释优化数据
2026年1月27日 30 24 13
数据集概述 本数据集为单细胞Iso-Seq技术优化基因组注释的补充数据，包含通过ScISOr-Seq技术生成的三刺鱼基因模型注释文件、CellRanger输出信息、Iso-Seq处理数据等，可提升scRNAseq分析中基因计数完整性与细胞类型识别准确性，支持基因组注释优化研究。 文件详解 文档文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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HMDP_Based_99个小鼠品系下丘脑转录组与eQTL分析数据
2026年1月27日 30 206 180
数据集概述 本数据集基于杂交小鼠多样性面板（HMDP）的99个近交系小鼠，通过RNA-Seq技术表征下丘脑转录组，包含蛋白质组分析支持的新转录本、新非编码RNA，以及局部和反式表达数量性状位点（eQTL）、可变剪接事件，可关联约150种代谢和心血管性状。 文件详解 文件名称：FileS2_ExpressionQTL.zip 文件格式：ZIP...
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Aculeata_Based_社会复杂性梯度可变剪接进化分化补充表格数据
2026年1月22日 30 92 41
数据集概述 本数据集为支持Aculeata昆虫社会复杂性梯度可变剪接进化分化研究的补充表格，包含一份Excel文件，记录相关研究的结构化数据，用于昆虫进化生物学领域的分析与验证。 文件详解 文件名称：SupplementaryTable.xlsx 文件格式：XLSX...
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FMR1_Iso_Seq_Based_脆性X相关疾病基因剪接异构体研究数据
2026年1月21日 30 17 16
数据集概述 本数据集为FMR1基因Iso-Seq测序的最终文件，包含49种FMR1基因剪接异构体的序列、表达量、开放阅读框比对等信息。数据来自对脆性X前突变携带者的研究，旨在分析FMR1基因剪接变异的表达模式及其与脆性X相关震颤/共济失调综合征（FXTAS）等疾病的关联。 文件详解 FMR1.49_isoforms.ORF_alignment.txt...
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PTB_Arabidopsis_Based可变剪接调控与发育过程关联研究数据
2026年1月20日 30 159 92
数据集概述 本数据集记录拟南芥多嘧啶 tract 结合蛋白同源物（PTB1、PTB2、PTB3）对可变剪接（AS）的调控作用，包含307个基因的452个AS事件，涉及种子萌发、开花调控等发育过程，为植物基因表达调控研究提供支撑。 文件详解 Supplemental Data Set1 AtPTB1_2 regulated events.xlsx...
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Arabidopsis_thaliana_Based_拟南芥重复基因可变剪接转录组分析数据
2026年1月17日 30 1 0
数据集概述 本数据集基于拟南芥RNA-seq数据，研究基因重复事件后可变剪接模式在重复基因间的保守性与分化程度。包含全基因组重复（alpha）和串联重复基因的可变剪接事件定性、定量分化情况，以及可变剪接诱导的无义介导降解（NMD）分化分析结果，共2个文件。 文件详解 README_for_Github_Dryad_repo.md 文件格式：MD...
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Drosophila_simulans_M252_马达加斯加菌株基因组组装注释数据
2026年1月14日 30 140 131
数据集概述 本数据集包含马达加斯加起源的果蝇Drosophila simulans M252菌株的基因组组装与注释结果，该菌株来自D. simulans的祖先分布区。数据验证了M252基因组的高质量，记录了52%多外显子基因的可变剪接、70%基因的UTR注释、225个新基因及781个假基因，为果蝇遗传学研究提供资源。 文件详解...
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Cell_Reports_Based_哺乳动物细胞转录逻辑计算通用化研究数据_2020
2026年1月14日 30 1 0
数据集概述 本数据集是论文“Multiple Alternative Promoters and Alternative Splicing Enable Universal Transcription-Based Logic Computation in Mammalian...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
2026年1月13日 30 73 23
数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Supplementary_Tables_Based_肾脏缺血再灌注损伤细胞状态与可变剪接动力学数据
2026年1月5日 30 41 17
数据集概述 本数据集为肾脏缺血再灌注损伤（IRI）相关研究的补充表格集合，包含基因表达计数、主题建模结果、细胞亚型标记基因列表、基因本体（GO）富集分析结果及可变剪接外显子信息等10个表格，覆盖肾脏IRI后的细胞状态变化与分子调控机制相关数据。 文件详解 Table S1 - Counts matrix.Ver-3.xlsx 文件格式：XLSX...
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生物医学可变剪接可视化网络应用使用说明
2025年12月19日 30 185 138
数据集概述 本数据集为GeneAPPExplorer生成的示例输出文件，展示了GeneAPP（一款注册软件）在整合、探索和可视化可变剪接数据方面的应用。GeneAPP通过客户端-服务器管道套件，将不同工具的差异可变剪接分析结果与生物数据库结合，提供图形化展示，辅助实验验证候选靶点的选择。 文件详解 文件名称:...
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小鼠出生后肌肉成熟转录组特征数据集_肌病相关基因研究
2025年12月15日 30 19 0
数据集概述 该数据集为发表研究“Transcriptomic characterization of postnatal muscle maturation in mice, with a focus on myopathy-associated...
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拟南芥冷响应转录组的可变剪接动态数据集
2025年12月14日 30 134 2
数据集概述 本数据集通过RNA测序分析拟南芥在低温胁迫下的转录组变化，聚焦可变剪接（AS）的动态响应。核心内容包括早期冷响应AS基因、转录因子及剪接调控因子的鉴定，揭示AS在植物低温适应中的作用，为研究植物低温耐受性的分子机制提供数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件，具体说明如下： - 数据文件（共16个，.xlsx格式）： -...
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不同温度下埃及伊蚊中肠可变剪接事件数据集
2025年12月13日 30 175 161
数据集概述 本数据集记录不同温度（20、28、36°C）下埃及伊蚊中肠组织的可变剪接事件分析结果，涵盖五种主要剪接类型及事件水平统计数据，含rMATS分析脚本，为研究环境温度对蚊虫基因表达调控机制提供支持。 文件详解 文件名称: results_rmats.zip 文件格式: ZIP 内容说明:...
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小立碗藓SMG1基因缺失对质量控制通路影响研究数据集
2025年12月9日 30 91 72
数据集概述 本数据集基于RNA-seq和机器学习方法，研究小立碗藓（Physcomitrella patens）中SMG1基因在mRNA、DNA及蛋白质质量控制通路中的作用，包含转录组分析、表型数据及相关代码文件，为植物质量控制过程研究提供数据支持。 文件详解...
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拟南芥MDF基因调控RNA剪接与基因表达的RNA_seq和RT_qPCR数据集
2025年12月7日 30 168 94
数据集概述 本数据集包含拟南芥中MERISTEM-DEFECTIVE（MDF）基因调控RNA剪接与基因表达的RNA-seq和RT-qPCR实验数据，涉及根分生组织功能相关转录本的剪接分析、胁迫响应下的异构体积累及核质穿梭等内容，为研究MDF在分生组织干细胞维持和基因表达调控中的作用提供支持。 文件详解 核心数据文件（.xlsx格式，共30个）：...
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稻属斑点稻Rubisco活化酶基因鉴定与表征数据集
2025年12月5日 30 183 128
数据集概述 本数据集围绕稻属斑点稻（Oryza punctata）的Rubisco活化酶（Rca）基因展开，包含其分子特征、转录本差异、表达模式及蛋白互作等研究结果，为理解光合作用关键基因的功能提供数据支持。 文件详解 文件名称：Supplement data.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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MARVEL可变剪接分析数据集
2025年12月5日 30 129 68
数据集概述 本数据集包含用于复现MARVEL可变剪接分析研究的文件，支持对应研究论文的分析结果验证与复现，涵盖HTML格式报告与软件压缩包。 文件详解 文件名称: MARVEL_Droplet.html，文件格式: HTML，为Droplet实验的分析报告网页文件。 文件名称: MARVEL_Plate.html，文件格式:...
