数据集概述
本数据集记录拟南芥多嘧啶 tract 结合蛋白同源物（PTB1、PTB2、PTB3）对可变剪接（AS）的调控作用，包含307个基因的452个AS事件，涉及种子萌发、开花调控等发育过程，为植物基因表达调控研究提供支撑。
文件详解
- Supplemental Data Set1 AtPTB1_2 regulated events.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录受PTB1和PTB2调控的可变剪接事件，包含基因信息、剪接类型（如内含子保留、外显子跳跃等）及调控方向
- Supplemental Data Set2 AtPTB3 regulated events.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录受PTB3调控的可变剪接事件，包含基因信息、剪接类型及调控特征
- Supplemental Data Set3 GO term analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：对PTB调控基因的GO功能富集分析结果，包含生物学过程、分子功能、细胞组分等注释信息
数据来源
论文“Polypyrimidine tract-binding protein homologues from Arabidopsis are key regulators of alternative splicing with implications in fundamental developmental processes”
适用场景
- 植物可变剪接调控机制研究：分析PTB蛋白对拟南芥基因可变剪接的调控模式与分子机制
- 植物发育生物学研究：探究PTB介导的可变剪接事件在种子萌发、开花等发育过程中的功能
- 基因功能注释分析：利用GO富集结果挖掘PTB调控基因参与的生物学过程
- 植物分子育种靶点筛选：识别影响植物关键性状的可变剪接调控位点，为分子育种提供参考
