数据集概述
本数据集来自挪威大规模公民科学研究，包含271户住宅的807份室内外灰尘样本，通过DNA metabarcoding分析室内真菌群落。数据涵盖样本元数据、生物信息学分析脚本、OTU表、分类学数据及统计分析脚本等25个文件，用于研究室内真菌群落组成、环境影响因素及公民科学方法的应用。
文件详解
- 元数据与数据文件
- 文件名称：metadata_file_dust_samples.xlsx、52_continuous_variables.xlsx、edited_lulu_curated_otutable.xlsx、taxonomy_for_rarTable_funguild.xlsx、OTU_table_rar2000x10.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含灰尘样本元数据、52个连续环境变量、经过LULU curated的OTU表、真菌分类学数据及稀释后的OTU表等。
- 生物信息学与统计脚本
- 文件名称：HouseDustMyco_bioinformatics_script_filtering_otutable.R、HouseDustMyco_statistics_script1_environmental_variables.R、HouseDustMyco_statistics_script2_diversity_indices.R、HouseDustMyco_statistics_script5_indoor_vs_outdoor.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于OTU表过滤、环境变量分析、多样性指数计算及室内外样本比较的R脚本。
- 文档与映射文件
- 文件名称：README_HouseDustMyco.txt、map_lib3.txt、map_lib4.txt、map_lib5.txt、map_lib8.txt、fastq_files_map_files_per_library.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档、各文库的映射文件及fastq文件与映射文件的对应关系。
- 序列文件
- 文件名称：OTU_representative_ITS2_seqs.centroids
- 文件格式：centroids
- 字段映射介绍：OTU代表性ITS2序列的centroids文件。
数据来源
论文“Analysing indoor mycobiomes through a large‐scale citizen science study in Norway”
适用场景
- 室内真菌群落研究：分析不同住宅环境中真菌群落组成、多样性及室内外差异。
- 环境因素与真菌群落关联分析：探究气候、建筑特征及居住者特性对室内真菌群落的影响。
- 公民科学方法应用评估：验证大规模地理尺度下公民科学在建筑微生物组研究中的可行性。
- 真菌分类与功能预测：基于OTU表和分类学数据进行真菌功能 guild 预测及生态类群分析。
- 生物信息学分析流程参考：利用提供的R脚本复现或优化真菌群落的生物信息学及统计分析流程。
