数据集概述
本数据集为2014-2015年欧亚/北美高致病性禽流感病毒(HPAIV)的进化与流行病学动态研究数据,包含8个文件,用于分析病毒在野生鸟类和家禽中的传播阈值(R0)、宿主间迁移及不同病毒株的适应性,验证病毒传播相关假设。
文件详解
- XML格式数据文件(共5个)
- 文件名称:hpwestwildpb210ma.xml、bdmmM2344v310Ma.xml、bdmmPB22344v310Ma.xml、clade2344v310Ma.xml、hpwestwildha10Ma.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含病毒进化与种群动力学模型参数,如传播阈值(R0)、宿主间病毒迁移率、不同病毒株(EA H5N8、EA/NA H5N2)的传播参数等
- tree格式数据文件(共3个)
- 文件名称:HAv3mcc.p50.mean.tree、Mv3mcc.p50.mean.tree、PB2v3mcc.p50.mean.tree
- 文件格式:tree
- 字段映射介绍:包含病毒进化树结构数据,反映病毒株的进化关系与分支特征
数据来源
论文“Inferring epidemiologic dynamics from viral evolution: 2014–2015 Eurasian/North American highly pathogenic avian influenza viruses exceed transmission threshold, R0 = 1, in wild birds and poultry in North America”
适用场景
- 禽流感病毒传播动力学研究: 分析HPAIV在野生鸟类和家禽中的传播阈值(R0)及持续传播能力
- 病毒进化与宿主适应性分析: 对比欧亚H5N8与欧亚/北美重组H5N2病毒株在北美野生鸟类中的传播适应性
- 跨宿主病毒迁移机制研究: 探究HPAIV在野生鸟类与家禽间的传播模式及迁移率
- 动物传染病防控策略制定: 为高致病性禽流感病毒的野生宿主监测与家禽疫情防控提供数据支持