找到21个数据集

标签: tree

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  • 复制数据_颜色与近红外反射率的共变性研究数据

    2026年2月1日 30 12 4

    数据集概述 本数据集为论文“Color and near-infrared reflectance covary in distinct ways across taxa”的复现数据,包含物种颜色及近红外反射率相关的全量数据集、多类群系统发育树文件,以及用于复现研究的R脚本,可支持跨类群反射率相关性分析,共含9个文件。 文件详解 代码文件...
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  • 整合鸟类虱子寄生虫的系统发育与群体遗传学进化数据

    2026年2月1日 30 53 9

    数据集概述 本数据集整合了寄生在新大陆地鸠身上的体虱全基因组序列的系统发育和种群遗传数据,用于分析寄生虫多样性的形成过程(如协同物种形成、宿主转换)。通过比较虱子与地鸠的系统发育关系,揭示了长期进化尺度下的系统发育一致性及宿主特异性,同时发现部分广食性虱子类群在种群水平上的生物地理结构。 文件详解 系统发育树文件(.tre、.tree、.trees)...
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  • Carex_Based_苔草属DNA序列系统发育研究补充数据

    2026年1月29日 30 139 112

    数据集概述 本数据集为苔草属(Carex)首个大规模系统发育研究的补充数据,基于996个物种(占公认物种的50.23%)的ITS、ETS和matK三个DNA区域序列构建超级矩阵。数据包含系统发育树、DNA序列文件及分类单元列表,支持对苔草属早期分化结构、分类单元单系性的分析,挑战部分传统进化假说。 文件详解 系统发育树文件...
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  • Tree_of_Life_animal_diet_evolution_data

    2026年1月19日 30 136 79

    数据集概述 本数据集围绕动物生命树的饮食演化展开,包含1087个分类单元的饮食数据,涉及食肉、食草、杂食比例分析,以及饮食保守性、物种多样化速率关联和祖先饮食推测等核心研究内容,共包含4个文件。 文件详解 Dataset S2.tree 文件格式:.tree 字段映射介绍:动物系统发育树文件,用于展示分类单元的亲缘关系,支撑饮食演化的系统发育分析...
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  • turtle_phylogeny_全球龟类系统发育与气候关联多样化研究数据

    2026年1月21日 30 78 25

    数据集概述 本数据集支持全球龟类系统发育研究,包含80%龟类物种(591个体)的分子数据及分析结果,聚焦始新世-渐新世过渡期大陆边缘气候关联的多样化爆发。数据集含系统发育树、分歧时间分析文件、生物地理学模型代码等12个文件,用于验证气候与生物地理对龟类多样性的影响。 文件详解 系统发育树文件(.tre/.tree)...
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  • Vulpes_vulpes_Based_赤狐全分布区多基因谱系地理学研究数据

    2026年1月20日 30 191 148

    数据集概述 本数据集是赤狐(Vulpes vulpes)全分布区多基因谱系地理学研究的相关数据,包含线粒体DNA、核基因、Y染色体等多类型遗传数据及分析文件,用于探究赤狐的起源、种群分化、洲际基因交流及种群历史动态,支持赤狐物种形成机制的研究。 文件详解 系统发育树文件(.tree格式,共3个)...
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  • APOBEC3_Published_Data_系统发育与突变分析数据2023

    2026年1月20日 30 74 21

    数据集概述 本数据集为Otoole et al(2023)发表的APOBEC3相关研究数据,包含系统发育分析、状态重建、突变计数等多类型数据文件及分析脚本,总计43个文件,涵盖B.1、Clade IIb、Clade I、Clade IIa等分支的APOBEC3分区研究内容,支持论文中的系统发育重建、突变分析及图表生成等工作。 文件详解...
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  • 十字花科Physarieae族分子系统学研究数据_序列比对_进化树及补充图示

    2026年1月20日 30 199 172

    数据集概述 本数据集包含十字花科Physarieae族的分子系统学研究数据,涵盖ITS、LUMINIDEPENDENS(LD)核基因与ndhF叶绿体基因的序列比对文件、系统发育树文件及补充图。数据支持Physarieae族单系性及两大分支(DDNLS、PP)的划分,提升了近缘物种的系统发育分辨率,为该族进化历史及毛状体演化假说提供依据。 文件详解...
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  • HPAIV_2014_2015欧亚北美高致病性禽流感病毒进化与传播动力学研究数据

    2026年1月19日 30 176 35

    数据集概述 本数据集为2014-2015年欧亚/北美高致病性禽流感病毒(HPAIV)的进化与流行病学动态研究数据,包含8个文件,用于分析病毒在野生鸟类和家禽中的传播阈值(R0)、宿主间迁移及不同病毒株的适应性,验证病毒传播相关假设。 文件详解 XML格式数据文件(共5个)...
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  • bird_mitochondrial_Based_鸟类线粒体DNA体重校正分子速率研究数据

    2026年1月12日 30 190 5

    数据集概述 本数据集为鸟类线粒体DNA体重校正分子速率研究的工作实例,包含475种鸟类线粒体基因组数据,通过分析体重与替代速率的关系构建校正模型,用于提升鸟类分子定年研究的准确性。数据集含9个文件,涵盖示例数据、代码及结果文件。 文件详解 文档文件...
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  • Fungal_Denitrifiers_Global_Soils_分布与环境驱动因素研究数据

    2026年1月12日 30 91 70

    数据集概述 本数据集包含与论文“Distribution and Environmental Drivers of Fungal Denitrifiers in Global...
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  • Grallaria_hypoleuca_Based_安第斯山脉蚁鸫物种形成历史研究数据_原始序列与系统发育文件

    2025年12月28日 30 22 0

    数据集概述 本数据集为安第斯山脉“湾背蚁鸫”复合体(Grallaria hypoleuca s. l.)物种形成历史研究的序列数据与系统发育分析结果,包含线粒体DNA与GBS技术生成的短读序列,以及系统发育树、基因分型等文件,共16个文件,用于解析该鸟类类群的地理分化历史与演化过程。 文件详解 系统发育树文件(.tree、.trees格式)...
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  • 园丁鸟造亭行为平行演化系统基因组学数据集

    2025年12月23日 30 33 25

    数据集概述 本数据集围绕园丁鸟造亭行为的演化机制展开,通过系统基因组学方法构建物种树,验证单配制猫鸟分支与多配制造亭物种的亲缘关系,探讨造亭行为是祖先性状丢失还是平行演化的结果,为理解这一独特行为的起源提供数据支持。 文件详解 归档文件(.tar格式): alignments_exons.tar:包含5653个外显子位点的比对文件...
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  • 叉尾豆娘属雌性颜色多态性分子系统发育数据集

    2025年12月23日 30 2 0

    数据集概述 本数据集围绕叉尾豆娘属(Ischnura)的分子系统发育展开,包含41个现存物种的分子数据与化石信息,通过多物种 coalescent 方法构建时间校准的系统发育树,分析雌性颜色多态性的宏进化历史,为研究该类群性限制多态性的动态演化提供基础。 文件详解 系统发育分析文件:...
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  • 头型对经典慈鲷咽颌创新多样化的调节作用数据集

    2025年12月18日 30 45 10

    数据集概述 本数据集围绕新热带慈鲷的咽颌形态创新展开,探究头型(尤其是头宽)对咽颌形态多样化的调节作用,为理解功能创新与生态多样性分布不均的关系提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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  • 大区域数量下生物地理学贝叶斯分析数据集

    2025年12月12日 30 147 124

    数据集概述 该数据集支持一项关于生物地理学贝叶斯分析的研究,旨在解决传统方法在处理大数量地理区域时的计算限制。研究提出基于数据增强的贝叶斯框架,通过马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法边缘化所有可能的生物地理历史,可扩展至更现实的大区域生物地理分析场景,支持模型参数估计与客观比较。 文件详解 文件名称:supp_vireya_map.pdf...
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  • 狐猴系统发育与分化时间数据集

    2025年12月10日 30 8 2

    数据集概述 本数据集整合形态学与DNA序列数据,通过尖端定年(TD)和化石化生死过程(FBD)模型,推断现生及灭绝狐猴的系统发育关系与分化时间,涉及马达加斯加特有狐猴88%的类群,为灵长类演化历史研究提供支持。 文件详解...
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  • 有颌脊椎动物系统发育与早期演化分析数据集

    2025年12月8日 30 46 30

    数据集概述 本数据集围绕有颌脊椎动物的系统发育展开,通过修正形态学数据集并采用贝叶斯尖端定年形态钟方法,探究盾皮鱼类的单系性及有颌脊椎动物的早期演化速率,为理解颌起源这一关键进化事件提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_information.pdf 文件格式: PDF 内容: 补充说明文档,包含研究方法、结果细节等辅助信息...
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  • 细菌基因组编码的特殊代谢物生物合成多样性纲要数据集

    2025年12月6日 30 106 3

    数据集概述 本数据集围绕细菌基因组编码的特殊代谢物生物合成多样性展开研究,通过分析约17万个细菌基因组和4.7万个宏基因组组装基因组,揭示不同细菌类群的生物合成潜力,重点识别具有高多样性代谢物合成能力的类群,为抗生素和癌症治疗药物研发提供数据支持。 文件详解 该数据集包含10个文件,具体说明如下: - 表格数据文件: -...
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  • Niphargus表型变异与系统发育信号分析数据集

    2025年12月5日 30 14 13

    数据集概述 本数据集包含用于分析Niphargus(端足目:Niphargidae)表型变异的系统发育信号所需的数据和R代码。数据基于相关研究文献,为探究该物种表型变异的进化机制提供支持。 文件详解 文件名称: Rcode_phylogenetic_signal_test.html,文件格式: HTML (.html) 内容:...
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