数据集概述
本数据集围绕叉尾豆娘属(Ischnura)的分子系统发育展开,包含41个现存物种的分子数据与化石信息,通过多物种 coalescent 方法构建时间校准的系统发育树,分析雌性颜色多态性的宏进化历史,为研究该类群性限制多态性的动态演化提供基础。
文件详解
- 系统发育分析文件:
- StarBEAST2_ischnura.xml:XML格式,StarBEAST2分析的配置文件
- StarBEAST2_summary.tree:系统发育树文件,包含叉尾豆娘属的时间校准系统发育结果
- StarBEAST2_SampleTrees.pdf:PDF格式,展示系统发育分析的样本树可视化结果
- 性状进化分析文件:
- BayesTraits_MultistateCommand.txt:TXT格式,BayesTraits软件用于多态性状态重建的命令文件
- BayesTraits_FMorph.txt:TXT格式,记录雌性形态数据的文本文件
- SM_ExpandedStateReconstruction.pdf:PDF格式,扩展的状态重建结果可视化文档
- 分布与统计分析文件:
- MCMCglmm_ischnura_distribution.csv:CSV格式,包含物种分布数据,字段包括分类单元、雌性状态、分布国家等
- MCMCglmm_RangeSizeglmm.pdf:PDF格式,地理分布范围与多态性关联分析的结果图表
- 补充材料文件:
- SM_Metadata.txt:TXT格式,补充材料的元数据说明
- SM_concatenated.fasta:FASTA格式,串联的分子序列数据文件
- SM_IschnuraExpanded.nexus:NEXUS格式,扩展的系统发育分析输入文件
适用场景
- 进化生物学研究:分析叉尾豆娘属雌性颜色多态性的起源与演化历史
- 宏进化分析:探究物种地理分布范围与多态性发生率的关联机制
- 系统发育方法应用:验证多物种 coalescent 方法在昆虫类群时间校准中的效果
- 性选择与性冲突研究:为频率依赖的性冲突维持多态性假说提供系统发育证据支持