Hsf_Grasses_Based禾本科热应激转录因子适应性进化与表达数据

数据集概述

本数据集围绕禾本科植物热应激转录因子(Hsfs)展开,涵盖5种禾本科植物(水稻、玉米、高粱、狗尾草、短柄草)的Hsf基因系统发育关系、适应性进化及非生物胁迫下的表达模式分析,包含3个相关文件,支持基因进化与功能研究。

文件详解

  • 文件名称:protein.fas
  • 文件格式:FAS
  • 字段映射介绍:包含禾本科植物Hsf基因编码的蛋白质序列数据,用于系统发育分析和适应性进化检测。
  • 文件名称:A_file_1.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:推测包含Hsf基因的表达模式数据(如热、盐、干旱、冷胁迫下的表达量)或基因进化分析的统计结果(如正选择位点、基因复制/丢失事件记录)。
  • 文件名称:NJ_JTT1.nwk
  • 文件格式:NWK
  • 字段映射介绍:基于JTT模型构建的邻接(NJ)系统发育树文件,记录禾本科Hsf基因的系统发育关系。

数据来源

论文“Adaptive evolution and divergent expression of heat stress transcription factors in grasses”

适用场景

  • 植物分子进化研究:分析禾本科Hsf基因的系统发育关系、适应性进化机制及基因复制/丢失事件。
  • 非生物胁迫响应机制研究:探究Hsf基因在热、盐、干旱、冷胁迫下的表达模式差异,解析植物抗逆分子机制。
  • 作物遗传改良研究:挖掘禾本科Hsf基因的功能变异,为耐高温等抗逆作物品种培育提供靶点。
  • 蛋白质序列分析:基于FAS文件中的蛋白质序列,开展结构预测、保守域分析等研究。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.16 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。