数据集概述
本数据集围绕禾本科植物热应激转录因子(Hsfs)展开,涵盖5种禾本科植物(水稻、玉米、高粱、狗尾草、短柄草)的Hsf基因系统发育关系、适应性进化及非生物胁迫下的表达模式分析,包含3个相关文件,支持基因进化与功能研究。
文件详解
- 文件名称:protein.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含禾本科植物Hsf基因编码的蛋白质序列数据,用于系统发育分析和适应性进化检测。
- 文件名称:A_file_1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含Hsf基因的表达模式数据(如热、盐、干旱、冷胁迫下的表达量)或基因进化分析的统计结果(如正选择位点、基因复制/丢失事件记录)。
- 文件名称:NJ_JTT1.nwk
- 文件格式:NWK
- 字段映射介绍:基于JTT模型构建的邻接(NJ)系统发育树文件,记录禾本科Hsf基因的系统发育关系。
数据来源
论文“Adaptive evolution and divergent expression of heat stress transcription factors in grasses”
适用场景
- 植物分子进化研究:分析禾本科Hsf基因的系统发育关系、适应性进化机制及基因复制/丢失事件。
- 非生物胁迫响应机制研究:探究Hsf基因在热、盐、干旱、冷胁迫下的表达模式差异,解析植物抗逆分子机制。
- 作物遗传改良研究:挖掘禾本科Hsf基因的功能变异,为耐高温等抗逆作物品种培育提供靶点。
- 蛋白质序列分析:基于FAS文件中的蛋白质序列,开展结构预测、保守域分析等研究。