数据集概述
本数据集为胡蜂亚科(Vespinae)属间系统发育关系研究的基因组学数据,包含转录组组装、直系同源基因及串联数据矩阵等压缩文件,用于分析胡蜂与黄蜂的系统发育关系,挑战传统分类假说,探究社会性行为演化机制。
文件详解
- 转录组核苷酸序列组装包
- 文件名称:transcriptome_assemblies_nucleotide.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含胡蜂亚科昆虫转录组测序后的核苷酸序列组装数据
- 直系同源基因数据集
- 文件名称:orthologs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含胡蜂亚科属间直系同源基因序列数据
- 串联数据矩阵数据集
- 文件名称:concatenated_data_matrices.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于系统发育分析的串联基因序列矩阵数据
- 转录组开放阅读框组装包
- 文件名称:transcriptome_assemblies_orfs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含转录组序列中的开放阅读框(ORF)预测数据
- 去冗余开放阅读框组装包
- 文件名称:transcriptome_assemblies_orfs_nr_cdhit.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含经过CD-HIT去冗余处理的开放阅读框序列数据
数据来源
论文“Phylogenomic analysis of yellowjackets and hornets (Hymenoptera: Vespidae, Vespinae)”
适用场景
- 昆虫系统发育研究:分析胡蜂亚科属间亲缘关系,验证或修正传统分类系统
- 社会性行为演化分析:基于系统发育关系探究高度社会性黄蜂的行为演化机制
- 基因组学数据挖掘:利用转录组和直系同源基因数据开展功能基因研究
- 生物信息学方法验证:测试系统发育基因组学分析流程在昆虫分类中的应用效果