数据集概述
本数据集包含2447个宏基因组组装基因组(MAGs)及其注释信息,源自54人队列粪便宏基因组和缺氧甲基化胺富集培养物。数据支持Borton 2022年关于肠道微生物基因调控人类心血管疾病的研究,涵盖基因组注释、代谢总结、质量丰度统计及NMR原始数据。
文件详解
- HumanCohort_annotations.tsv.zip
- 文件格式:ZIP(含TSV文件)
- 字段映射介绍:包含2447个MAGs的自定义数据库及对应注释信息,用于心血管疾病相关肠道微生物基因研究。
- HumanCohortmetabolism_summary.xlsx.zip
- 文件格式:ZIP(含XLSX文件)
- 字段映射介绍:队列数据库中2447个MAGs的代谢注释总结表。
- Quality_Abundance_CohortMAGs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含2447个MAGs的基因组统计信息(如质量指标)和相对丰度数据。
- orig_1D_NMR_fids.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:源自缺氧甲基化胺富集培养物的一维核磁共振(NMR)原始数据文件。
数据来源
Borton 2022研究:"Targeted curation of the gut microbial gene content modulating human cardiovascular disease"
适用场景
- 肠道微生物基因组研究:分析2447个MAGs的基因组成与功能注释,探索肠道微生物多样性。
- 心血管疾病关联分析:研究肠道微生物基因对人类心血管疾病的调控机制。
- 微生物代谢特征研究:利用代谢总结数据解析肠道微生物的代谢通路与功能。
- 宏基因组数据质量评估:通过基因组统计信息验证MAGs的组装质量与丰度分布。
- 微生物培养物NMR分析:基于原始NMR数据研究缺氧甲基化胺富集培养物的代谢特性。